More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3596 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  66.95 
 
 		 478 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  97.33 
 
 		 374 aa  737    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 474 aa  952    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  64.29 
 
 		 477 aa  580  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  60.33 
 
 		 480 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  60.18 
 
 		 483 aa  532  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  54.41 
 
 		 479 aa  479  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  50.21 
 
 		 477 aa  428  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  49.79 
 
 		 502 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  47 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.81 
 
 		 474 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.84 
 
 		 477 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  49.13 
 
 		 477 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.15 
 
 		 489 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.89 
 
 		 464 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.46 
 
 		 464 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  47.67 
 
 		 481 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.9 
 
 		 476 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  47.12 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  47.82 
 
 		 481 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  44.28 
 
 		 482 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  44 
 
 		 476 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  43.83 
 
 		 476 aa  360  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.03 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.76 
 
 		 474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  44.31 
 
 		 476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  45.21 
 
 		 486 aa  355  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  43 
 
 		 476 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  41.34 
 
 		 474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  44.38 
 
 		 486 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.34 
 
 		 472 aa  338  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.95 
 
 		 478 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  42.68 
 
 		 486 aa  335  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  37.21 
 
 		 484 aa  335  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  40.61 
 
 		 478 aa  332  8e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  42.26 
 
 		 486 aa  332  9e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.61 
 
 		 478 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  38.35 
 
 		 500 aa  330  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.74 
 
 		 478 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  39.5 
 
 		 474 aa  319  7.999999999999999e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  41.52 
 
 		 467 aa  317  4e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  40.66 
 
 		 482 aa  313  5.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  41.68 
 
 		 478 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  40 
 
 		 487 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.78 
 
 		 487 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  39.75 
 
 		 467 aa  296  8e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  34.5 
 
 		 485 aa  293  3e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  38 
 
 		 487 aa  292  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  32.64 
 
 		 486 aa  273  4.0000000000000004e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.28 
 
 		 541 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.41 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.1 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  33.26 
 
 		 499 aa  242  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  31.82 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  28.4 
 
 		 483 aa  239  6.999999999999999e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  30.72 
 
 		 502 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.93 
 
 		 485 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  30.72 
 
 		 476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  33.9 
 
 		 474 aa  233  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  33.48 
 
 		 486 aa  232  8.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  30.59 
 
 		 476 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.84 
 
 		 492 aa  229  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  31.04 
 
 		 502 aa  229  9e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  33.18 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.13 
 
 		 425 aa  227  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.03 
 
 		 483 aa  225  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  34.02 
 
 		 479 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.05 
 
 		 486 aa  223  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  33.12 
 
 		 490 aa  223  7e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  29.31 
 
 		 490 aa  223  8e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  34.61 
 
 		 481 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  29.67 
 
 		 480 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  34.33 
 
 		 479 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  33.91 
 
 		 471 aa  219  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  29.88 
 
 		 486 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  31.56 
 
 		 484 aa  218  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.26 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  30.11 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  31.8 
 
 		 477 aa  218  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  30.11 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  35.62 
 
 		 478 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  34.36 
 
 		 483 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  32.07 
 
 		 494 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  32.07 
 
 		 494 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.42 
 
 		 490 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  33.54 
 
 		 478 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  28.28 
 
 		 481 aa  216  7e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  32.83 
 
 		 478 aa  216  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.9 
 
 		 526 aa  216  8e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  30.93 
 
 		 514 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  31.13 
 
 		 514 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  30.93 
 
 		 514 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  30.93 
 
 		 514 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  30.93 
 
 		 514 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  30.93 
 
 		 514 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  30.93 
 
 		 514 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  29.62 
 
 		 488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  30.93 
 
 		 514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.07 
 
 		 482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  32.2 
 
 		 479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>