More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0191 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  68.5 
 
 
480 aa  667    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
478 aa  975    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  70.13 
 
 
477 aa  662    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  66.95 
 
 
474 aa  623  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  70.29 
 
 
374 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  58.59 
 
 
483 aa  532  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  52.1 
 
 
477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  52.06 
 
 
479 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.67 
 
 
489 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  47.02 
 
 
484 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  48.5 
 
 
502 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.73 
 
 
474 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.61 
 
 
477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.93 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.72 
 
 
464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  47.01 
 
 
477 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  46.67 
 
 
472 aa  393  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  47.19 
 
 
481 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.1 
 
 
476 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  45.68 
 
 
481 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.83 
 
 
474 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.58 
 
 
476 aa  356  5e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  42.62 
 
 
476 aa  356  5e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  42.58 
 
 
476 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  42.04 
 
 
476 aa  353  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  42.43 
 
 
482 aa  350  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.18 
 
 
472 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  39.36 
 
 
484 aa  347  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  41.1 
 
 
486 aa  344  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  44.15 
 
 
486 aa  344  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  39.24 
 
 
500 aa  343  5.999999999999999e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  40.9 
 
 
486 aa  342  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  41.92 
 
 
486 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.9 
 
 
472 aa  341  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.38 
 
 
478 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.29 
 
 
478 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  40.17 
 
 
474 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  38.76 
 
 
474 aa  325  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  40.92 
 
 
467 aa  325  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.48 
 
 
478 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  40.26 
 
 
478 aa  319  7e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.18 
 
 
487 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  40.74 
 
 
482 aa  306  6e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  39.11 
 
 
487 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.17 
 
 
487 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  40.68 
 
 
478 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  39.5 
 
 
467 aa  290  4e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  34.36 
 
 
485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  32.57 
 
 
486 aa  280  5e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.45 
 
 
541 aa  266  5e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  32.99 
 
 
499 aa  251  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  31.94 
 
 
485 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  31.95 
 
 
514 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  31.74 
 
 
514 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.13 
 
 
481 aa  244  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  31.74 
 
 
514 aa  243  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  31.74 
 
 
514 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  31.74 
 
 
514 aa  243  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  31.74 
 
 
514 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  31.74 
 
 
514 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  34.14 
 
 
477 aa  242  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  31.74 
 
 
514 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.96 
 
 
472 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  31.54 
 
 
514 aa  240  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  31.54 
 
 
514 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  31.85 
 
 
480 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  31.49 
 
 
490 aa  237  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.09 
 
 
478 aa  238  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.44 
 
 
492 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  28.69 
 
 
483 aa  234  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  29.75 
 
 
502 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.82 
 
 
485 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  31.22 
 
 
486 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  31.87 
 
 
514 aa  230  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.33 
 
 
483 aa  231  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.78 
 
 
482 aa  229  8e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  31.56 
 
 
509 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  32.08 
 
 
477 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  32.08 
 
 
477 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  30.29 
 
 
502 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  33.6 
 
 
479 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  33.54 
 
 
481 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  31.95 
 
 
478 aa  226  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  31.13 
 
 
509 aa  225  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  31.56 
 
 
509 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  31.56 
 
 
509 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  32.99 
 
 
479 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  31.56 
 
 
509 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  31.34 
 
 
509 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  31.34 
 
 
509 aa  224  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  29.94 
 
 
509 aa  224  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  31.08 
 
 
509 aa  223  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  30.88 
 
 
509 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  32.11 
 
 
488 aa  221  3e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  29.9 
 
 
494 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  29.9 
 
 
494 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.22 
 
 
477 aa  219  6e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  34.1 
 
 
462 aa  219  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  30.35 
 
 
481 aa  218  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.43 
 
 
484 aa  218  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>