More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5530 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  74.74 
 
 		 479 aa  751    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  74.95 
 
 		 481 aa  753    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  100 
 
 		 479 aa  979    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  75.16 
 
 		 479 aa  771    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  95.2 
 
 		 479 aa  947    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  76.62 
 
 		 479 aa  781    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  65.27 
 
 		 481 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  73.49 
 
 		 479 aa  765    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  68.43 
 
 		 490 aa  671    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  68.43 
 
 		 491 aa  670    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  64.59 
 
 		 481 aa  622  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  57.96 
 
 		 477 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  57.96 
 
 		 477 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  58.6 
 
 		 489 aa  560  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4057  cardiolipin synthetase  56.84 
 
 		 518 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  56.12 
 
 		 505 aa  539  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  55.72 
 
 		 483 aa  532  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  56.17 
 
 		 478 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  55.42 
 
 		 483 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  56.78 
 
 		 479 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  56.21 
 
 		 479 aa  519  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  55.58 
 
 		 479 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  57.2 
 
 		 479 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  56.78 
 
 		 479 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  55.79 
 
 		 479 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  56.78 
 
 		 479 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  54.41 
 
 		 479 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  54.41 
 
 		 479 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  54.41 
 
 		 479 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  54.41 
 
 		 479 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  54.41 
 
 		 479 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  54.41 
 
 		 479 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  54.66 
 
 		 479 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2012  cardiolipin synthetase  55.08 
 
 		 479 aa  501  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  47.25 
 
 		 474 aa  431  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.63 
 
 		 490 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  45.01 
 
 		 490 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  42.73 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  40.4 
 
 		 441 aa  361  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2033  cardiolipin synthetase  41.77 
 
 		 484 aa  352  1e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0028874  hitchhiker  0.0000142083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  37.55 
 
 		 514 aa  306  6e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  37.34 
 
 		 514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  37.34 
 
 		 514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  37.34 
 
 		 514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  37.34 
 
 		 514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  37.34 
 
 		 514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  37.34 
 
 		 514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  37.34 
 
 		 514 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  37.14 
 
 		 514 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  37.14 
 
 		 514 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  37.45 
 
 		 514 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  37.4 
 
 		 502 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  36.11 
 
 		 499 aa  295  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  35.85 
 
 		 502 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.48 
 
 		 478 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  33.26 
 
 		 490 aa  276  9e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  33.68 
 
 		 487 aa  275  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.82 
 
 		 482 aa  274  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  39.51 
 
 		 484 aa  274  3e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  34.27 
 
 		 480 aa  272  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.12 
 
 		 541 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 		 509 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  33.54 
 
 		 509 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  32.86 
 
 		 509 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 		 509 aa  269  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  33.13 
 
 		 509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.62 
 
 		 485 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  33.13 
 
 		 509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  32.86 
 
 		 509 aa  267  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  33.05 
 
 		 509 aa  266  8e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  31.29 
 
 		 483 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  31.08 
 
 		 483 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  32.72 
 
 		 509 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.99 
 
 		 472 aa  262  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.93 
 
 		 477 aa  262  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  32.72 
 
 		 509 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  35.99 
 
 		 477 aa  258  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  33.62 
 
 		 494 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  33.62 
 
 		 494 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  32.64 
 
 		 485 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0093  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.4 
 
 		 463 aa  256  6e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325157 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  32.62 
 
 		 505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  32.62 
 
 		 505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.27 
 
 		 481 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  31.81 
 
 		 481 aa  254  3e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.59 
 
 		 486 aa  253  6e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  35.79 
 
 		 488 aa  250  4e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  35.27 
 
 		 484 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.5 
 
 		 526 aa  248  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  29.45 
 
 		 470 aa  246  6e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.12 
 
 		 483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  30.21 
 
 		 483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  37.16 
 
 		 477 aa  245  1.9999999999999999e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  31.42 
 
 		 495 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  32.42 
 
 		 473 aa  244  3e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  31.97 
 
 		 486 aa  243  7e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  31.53 
 
 		 490 aa  241  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1793  phospholipase D/transphosphatidylase  30.63 
 
 		 497 aa  242  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  29.28 
 
 		 476 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  29.07 
 
 		 476 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>