More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1935 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  80.79 
 
 
479 aa  772    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  72.65 
 
 
478 aa  698    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  90.4 
 
 
479 aa  866    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  81 
 
 
479 aa  776    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  81 
 
 
479 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  81 
 
 
479 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  90.4 
 
 
479 aa  867    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  100 
 
 
479 aa  973    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  71.43 
 
 
483 aa  693    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  81 
 
 
479 aa  776    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2012  cardiolipin synthetase  81.21 
 
 
479 aa  761    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  71.01 
 
 
483 aa  691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  89.35 
 
 
479 aa  860    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  81 
 
 
479 aa  776    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  89.56 
 
 
479 aa  840    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  99.37 
 
 
479 aa  969    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  89.56 
 
 
479 aa  840    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  81 
 
 
479 aa  776    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  58.82 
 
 
491 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4057  cardiolipin synthetase  60.59 
 
 
518 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  58.32 
 
 
479 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  59.96 
 
 
505 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  58.4 
 
 
490 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  58.69 
 
 
477 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  58.69 
 
 
477 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  60.81 
 
 
489 aa  533  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  55.58 
 
 
479 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  54.74 
 
 
479 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  54.53 
 
 
479 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  54.32 
 
 
479 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  55.41 
 
 
479 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  54.76 
 
 
481 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  54.18 
 
 
481 aa  485  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  52.89 
 
 
481 aa  482  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.09 
 
 
490 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  48.54 
 
 
490 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  47.67 
 
 
474 aa  434  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  42.19 
 
 
441 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  41.72 
 
 
478 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2033  cardiolipin synthetase  42.14 
 
 
484 aa  362  7.0000000000000005e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0028874  hitchhiker  0.0000142083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  34.92 
 
 
514 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  34.77 
 
 
514 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  34.92 
 
 
514 aa  310  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  34.71 
 
 
514 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  34.5 
 
 
514 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  34.5 
 
 
514 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  34.5 
 
 
514 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  34.5 
 
 
514 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  34.5 
 
 
514 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  34.3 
 
 
514 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  33.54 
 
 
514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  34.7 
 
 
502 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  32.91 
 
 
502 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.32 
 
 
541 aa  279  7e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  31.13 
 
 
509 aa  274  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  33.54 
 
 
485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.68 
 
 
526 aa  271  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  30.2 
 
 
509 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  30.2 
 
 
509 aa  270  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  31.36 
 
 
509 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  30.88 
 
 
509 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  31.1 
 
 
509 aa  269  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  30.67 
 
 
509 aa  269  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  31.36 
 
 
509 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  30.46 
 
 
509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  30.46 
 
 
509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.74 
 
 
482 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  33.27 
 
 
487 aa  264  3e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.3 
 
 
472 aa  263  4.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.74 
 
 
486 aa  263  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.37 
 
 
477 aa  260  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  32.21 
 
 
480 aa  259  8e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  36.48 
 
 
486 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  32.36 
 
 
499 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  32.04 
 
 
490 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.06 
 
 
485 aa  252  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.75 
 
 
478 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  37.13 
 
 
484 aa  251  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.28 
 
 
481 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.52 
 
 
492 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  29.92 
 
 
483 aa  243  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  29.92 
 
 
483 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  33.94 
 
 
477 aa  241  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  30.16 
 
 
505 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  30.16 
 
 
505 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  30.42 
 
 
494 aa  239  6.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  30.42 
 
 
494 aa  239  6.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  30.06 
 
 
488 aa  239  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  30 
 
 
490 aa  238  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  30.11 
 
 
470 aa  237  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  29.88 
 
 
486 aa  235  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  29.02 
 
 
483 aa  236  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  33.13 
 
 
481 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  30.75 
 
 
477 aa  233  8.000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  34.06 
 
 
484 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  29.09 
 
 
476 aa  227  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.93 
 
 
495 aa  228  3e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.52 
 
 
486 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.47 
 
 
498 aa  226  9e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.24 
 
 
472 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>