More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1793 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1793  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
497 aa  1031    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  65.12 
 
 
495 aa  683    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  46.95 
 
 
487 aa  464  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  47.33 
 
 
484 aa  439  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0093  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  44.26 
 
 
463 aa  424  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325157 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  43.94 
 
 
505 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  43.94 
 
 
505 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  42.28 
 
 
490 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  44.79 
 
 
494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  44.79 
 
 
494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  44.49 
 
 
488 aa  398  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  41.36 
 
 
477 aa  397  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  40.87 
 
 
481 aa  379  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  43.19 
 
 
490 aa  375  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.42 
 
 
482 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  41.55 
 
 
477 aa  371  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  40.94 
 
 
485 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  38.25 
 
 
499 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  39.13 
 
 
483 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.23 
 
 
472 aa  343  4e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  39.13 
 
 
483 aa  342  8e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.5 
 
 
541 aa  335  9e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  38.71 
 
 
476 aa  333  4e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  38.49 
 
 
476 aa  329  6e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  36.55 
 
 
502 aa  316  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  36.09 
 
 
480 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  35.42 
 
 
514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  35.03 
 
 
514 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  34.83 
 
 
514 aa  300  4e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  35.03 
 
 
514 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  35.03 
 
 
514 aa  300  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  35.03 
 
 
514 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  35.03 
 
 
514 aa  300  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  35.03 
 
 
514 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  34.65 
 
 
514 aa  299  8e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  34.83 
 
 
514 aa  299  9e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  34.64 
 
 
514 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.17 
 
 
486 aa  293  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  33.13 
 
 
502 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  34.84 
 
 
509 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  33.88 
 
 
483 aa  287  4e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.69 
 
 
485 aa  286  5.999999999999999e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  34.43 
 
 
509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  34.22 
 
 
509 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  34.02 
 
 
509 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  34.22 
 
 
509 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  34.02 
 
 
509 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  34.02 
 
 
509 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  33.95 
 
 
509 aa  279  9e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  35.16 
 
 
470 aa  277  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.41 
 
 
478 aa  276  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  33.2 
 
 
509 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  33.2 
 
 
509 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.46 
 
 
492 aa  269  7e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  33.06 
 
 
473 aa  265  1e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0911  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.26 
 
 
485 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000528236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  32.51 
 
 
479 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  31.48 
 
 
479 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  31.28 
 
 
479 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  31.88 
 
 
481 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  35.64 
 
 
486 aa  257  4e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.04 
 
 
483 aa  256  5e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  31.43 
 
 
477 aa  256  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  31.65 
 
 
479 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  31.43 
 
 
477 aa  256  8e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  32.75 
 
 
484 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.98 
 
 
498 aa  254  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.6 
 
 
526 aa  253  6e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.9 
 
 
508 aa  252  9.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.44 
 
 
481 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  31.22 
 
 
479 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.47 
 
 
477 aa  246  6e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  30.83 
 
 
481 aa  245  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  30.93 
 
 
481 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.33 
 
 
490 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  30.25 
 
 
489 aa  243  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  30.37 
 
 
490 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  30.58 
 
 
491 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  30.2 
 
 
479 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  29.07 
 
 
474 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  30.17 
 
 
505 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  29.34 
 
 
479 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4057  cardiolipin synthetase  29.78 
 
 
518 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  28.86 
 
 
479 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  28.46 
 
 
479 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  28.66 
 
 
479 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  29.69 
 
 
479 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.33 
 
 
486 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  29.69 
 
 
479 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  29.69 
 
 
479 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3346  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.48 
 
 
395 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  29.69 
 
 
479 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  29.69 
 
 
479 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  28.72 
 
 
479 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  29.69 
 
 
479 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  28.72 
 
 
479 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  30.45 
 
 
478 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  29.7 
 
 
479 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0345  cardiolipin synthetase  30.6 
 
 
511 aa  226  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0354  cardiolipin synthetase  31.08 
 
 
511 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00517773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>