More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4057 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  70.12 
 
 
477 aa  685    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  71.67 
 
 
489 aa  660    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4057  cardiolipin synthetase  100 
 
 
518 aa  1052    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  76.75 
 
 
505 aa  758    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  70.12 
 
 
477 aa  685    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  61.13 
 
 
483 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  61.38 
 
 
483 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  57.17 
 
 
479 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  60.93 
 
 
478 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  60.59 
 
 
479 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  56.84 
 
 
479 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  61.65 
 
 
479 aa  561  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  61.39 
 
 
479 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  56.39 
 
 
479 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  60.96 
 
 
490 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  60.75 
 
 
491 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  56.18 
 
 
479 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  55.79 
 
 
479 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  61.02 
 
 
479 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  57.39 
 
 
481 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  60.59 
 
 
479 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  60.5 
 
 
479 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  60.5 
 
 
479 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  60.5 
 
 
479 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  60.5 
 
 
479 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  60.5 
 
 
479 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  61.23 
 
 
479 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  57.39 
 
 
479 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  61.23 
 
 
479 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  60.5 
 
 
479 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  60.5 
 
 
479 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2012  cardiolipin synthetase  60.71 
 
 
479 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  56.58 
 
 
481 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  57.66 
 
 
481 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  47.97 
 
 
490 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.89 
 
 
490 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  45 
 
 
474 aa  418  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  42.35 
 
 
441 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  44.96 
 
 
478 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2033  cardiolipin synthetase  40.67 
 
 
484 aa  356  3.9999999999999996e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0028874  hitchhiker  0.0000142083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  37.32 
 
 
502 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  33.19 
 
 
514 aa  302  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  32.99 
 
 
514 aa  301  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  32.99 
 
 
514 aa  301  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  32.99 
 
 
514 aa  301  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  32.99 
 
 
514 aa  301  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  32.99 
 
 
514 aa  301  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  32.99 
 
 
514 aa  301  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  35.81 
 
 
502 aa  300  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  32.78 
 
 
514 aa  299  8e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  32.78 
 
 
514 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  32.78 
 
 
514 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  32.78 
 
 
514 aa  296  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  34.66 
 
 
490 aa  290  3e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.32 
 
 
482 aa  290  6e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  30.91 
 
 
483 aa  280  6e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  30.5 
 
 
483 aa  279  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  31.5 
 
 
509 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  31.2 
 
 
509 aa  276  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  32.66 
 
 
499 aa  276  9e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  31.77 
 
 
509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  31.57 
 
 
509 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  31.57 
 
 
509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  31.57 
 
 
509 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  31.57 
 
 
509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  31 
 
 
509 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.55 
 
 
526 aa  271  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.73 
 
 
472 aa  271  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.28 
 
 
477 aa  271  2.9999999999999997e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.92 
 
 
478 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  30.57 
 
 
487 aa  270  5.9999999999999995e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.78 
 
 
541 aa  269  7e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  31.61 
 
 
509 aa  266  8e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  31.61 
 
 
509 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  35.52 
 
 
484 aa  263  4e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  30.24 
 
 
485 aa  262  8.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.26 
 
 
485 aa  262  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.4 
 
 
486 aa  260  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  30.12 
 
 
488 aa  258  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.81 
 
 
481 aa  256  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  30.72 
 
 
494 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  30.72 
 
 
494 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  30.75 
 
 
486 aa  254  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  30.9 
 
 
480 aa  253  7e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  30.39 
 
 
505 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  33.75 
 
 
477 aa  251  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  30.39 
 
 
505 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  29.58 
 
 
470 aa  250  4e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.67 
 
 
483 aa  248  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  29.02 
 
 
477 aa  248  2e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  28.46 
 
 
490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  28.85 
 
 
476 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  29.07 
 
 
476 aa  240  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  35.05 
 
 
486 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.07 
 
 
498 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  35.21 
 
 
484 aa  238  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  26.33 
 
 
483 aa  231  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0093  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32 
 
 
463 aa  231  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325157 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.46 
 
 
495 aa  232  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1793  phospholipase D/transphosphatidylase  29.78 
 
 
497 aa  230  4e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>