More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03470 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  72.43 
 
 
486 aa  690    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  100 
 
 
486 aa  986    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  50.32 
 
 
481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  49.28 
 
 
484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2057  cardiolipin synthetase 2  43.24 
 
 
486 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.830575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  38.27 
 
 
502 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  37.95 
 
 
514 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  37.95 
 
 
514 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  37.95 
 
 
514 aa  317  4e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  37.95 
 
 
514 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  37.95 
 
 
514 aa  317  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  37.95 
 
 
514 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  37.95 
 
 
514 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.35 
 
 
486 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  37.74 
 
 
514 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  37.23 
 
 
502 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  37.55 
 
 
514 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  37.74 
 
 
514 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  37.74 
 
 
514 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1900  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.77 
 
 
486 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  34.82 
 
 
509 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  34.61 
 
 
509 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  33.12 
 
 
509 aa  294  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  34.39 
 
 
509 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  33.12 
 
 
509 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  34.39 
 
 
509 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  34.39 
 
 
509 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  34.18 
 
 
509 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  34.18 
 
 
509 aa  293  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  36.49 
 
 
485 aa  293  6e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.08 
 
 
541 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 
509 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.6 
 
 
477 aa  286  5e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  33.26 
 
 
483 aa  283  6.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  34.96 
 
 
490 aa  282  9e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.19 
 
 
478 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.81 
 
 
492 aa  270  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.78 
 
 
485 aa  268  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  31.48 
 
 
494 aa  266  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  31.48 
 
 
494 aa  266  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  32.58 
 
 
480 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  33.4 
 
 
473 aa  265  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  36.23 
 
 
479 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  34.53 
 
 
482 aa  262  8.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  31.03 
 
 
470 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.5 
 
 
482 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.51 
 
 
478 aa  261  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  34.55 
 
 
477 aa  260  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.01 
 
 
478 aa  260  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  36.51 
 
 
478 aa  259  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.54 
 
 
483 aa  258  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  35.54 
 
 
479 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.46 
 
 
472 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  35.34 
 
 
474 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  35.92 
 
 
479 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  35.25 
 
 
479 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.48 
 
 
490 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  36.23 
 
 
479 aa  254  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  36.23 
 
 
479 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  31.52 
 
 
483 aa  252  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  35.02 
 
 
479 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  30.74 
 
 
488 aa  251  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  35.02 
 
 
479 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  35.02 
 
 
479 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  35.02 
 
 
479 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  35.02 
 
 
479 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  35.02 
 
 
479 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  30.71 
 
 
483 aa  252  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  35.29 
 
 
479 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  38.23 
 
 
481 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  31.67 
 
 
476 aa  249  7e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  33.12 
 
 
477 aa  249  8e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  35.82 
 
 
479 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  34.77 
 
 
479 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  36.63 
 
 
474 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2012  cardiolipin synthetase  36.23 
 
 
479 aa  247  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  31.45 
 
 
476 aa  247  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  35.93 
 
 
481 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  31.43 
 
 
478 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  37.37 
 
 
481 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  34.7 
 
 
478 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  35.23 
 
 
479 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  34.92 
 
 
490 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  35.5 
 
 
479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  35.5 
 
 
479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.2 
 
 
486 aa  243  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  35.65 
 
 
479 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.52 
 
 
478 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  31.85 
 
 
499 aa  242  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  33.84 
 
 
479 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  29.64 
 
 
490 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  36.53 
 
 
477 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  34.96 
 
 
483 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  34.3 
 
 
483 aa  239  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  30.77 
 
 
481 aa  239  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.05 
 
 
474 aa  239  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  33.98 
 
 
478 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  35.91 
 
 
476 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  34.98 
 
 
477 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  34.98 
 
 
477 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>