More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0735 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  99.17 
 
 
483 aa  970    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  100 
 
 
483 aa  977    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  48.23 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  48.23 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  46.14 
 
 
488 aa  403  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  41.88 
 
 
485 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  43.67 
 
 
505 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  43.67 
 
 
505 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  44.81 
 
 
490 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  39.83 
 
 
477 aa  368  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.84 
 
 
482 aa  364  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  41.68 
 
 
476 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  40.77 
 
 
476 aa  356  5e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.54 
 
 
472 aa  355  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  39.2 
 
 
481 aa  354  2e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  38.85 
 
 
490 aa  349  7e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  39.51 
 
 
499 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  40.42 
 
 
502 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1793  phospholipase D/transphosphatidylase  39.13 
 
 
497 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  38.91 
 
 
477 aa  335  1e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  38.67 
 
 
487 aa  333  6e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  37.7 
 
 
495 aa  332  8e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  38.14 
 
 
509 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  38.35 
 
 
509 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  38.14 
 
 
509 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.8 
 
 
541 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  38.14 
 
 
509 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  38.14 
 
 
509 aa  331  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  37.73 
 
 
509 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  37.94 
 
 
509 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  37.73 
 
 
509 aa  330  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  38.03 
 
 
484 aa  330  4e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  37.53 
 
 
509 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  38.6 
 
 
514 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  38.57 
 
 
502 aa  326  7e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  38.67 
 
 
514 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  37.45 
 
 
509 aa  323  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  38.46 
 
 
514 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  38.46 
 
 
514 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  38.46 
 
 
514 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  38.46 
 
 
514 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  38.46 
 
 
514 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  38.33 
 
 
514 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  38.25 
 
 
514 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  38.67 
 
 
514 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  37.92 
 
 
514 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  38 
 
 
470 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  35.71 
 
 
480 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.81 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  33.13 
 
 
477 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  33.13 
 
 
477 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  34.92 
 
 
483 aa  293  4e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0093  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  33.55 
 
 
463 aa  292  7e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325157 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.15 
 
 
490 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  32.85 
 
 
479 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.35 
 
 
483 aa  279  9e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  32.18 
 
 
479 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.85 
 
 
508 aa  274  3e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  31.19 
 
 
474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  32.92 
 
 
489 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 
478 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  32.75 
 
 
490 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  31.52 
 
 
505 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.1 
 
 
477 aa  270  2.9999999999999997e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.94 
 
 
485 aa  268  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4057  cardiolipin synthetase  30.5 
 
 
518 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  30.8 
 
 
479 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  35.22 
 
 
486 aa  266  5.999999999999999e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  32.18 
 
 
473 aa  266  8.999999999999999e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.64 
 
 
526 aa  265  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  31.75 
 
 
479 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  31.08 
 
 
479 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  31.62 
 
 
483 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  31.55 
 
 
483 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  31.53 
 
 
481 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0911  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.63 
 
 
485 aa  262  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000528236 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  31.22 
 
 
478 aa  262  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  30.8 
 
 
479 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  32.62 
 
 
481 aa  260  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  31.25 
 
 
478 aa  259  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.36 
 
 
498 aa  258  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0222  putative cardiolipin synthetase  31.19 
 
 
497 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.22 
 
 
481 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  32.43 
 
 
491 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  30.27 
 
 
479 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  32.43 
 
 
490 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  31.04 
 
 
479 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  30.27 
 
 
479 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  30.27 
 
 
479 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  30.27 
 
 
479 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  30.27 
 
 
479 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  30.27 
 
 
479 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  30.27 
 
 
479 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  30.27 
 
 
479 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  31.54 
 
 
479 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2012  cardiolipin synthetase  30.79 
 
 
479 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  32.05 
 
 
486 aa  247  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.35 
 
 
492 aa  247  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  36.62 
 
 
397 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  29.98 
 
 
481 aa  245  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>