More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0885 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  100 
 
 
490 aa  1000    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  75.67 
 
 
505 aa  783    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  75.67 
 
 
505 aa  783    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  55.69 
 
 
488 aa  558  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  55.9 
 
 
494 aa  552  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  55.9 
 
 
494 aa  552  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.64 
 
 
482 aa  443  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  45.68 
 
 
485 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  46.22 
 
 
481 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  44.33 
 
 
477 aa  421  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1793  phospholipase D/transphosphatidylase  41.75 
 
 
497 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  41.68 
 
 
487 aa  396  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  42.62 
 
 
484 aa  398  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  41.09 
 
 
499 aa  387  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  45.34 
 
 
483 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  44.81 
 
 
483 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.67 
 
 
541 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  40.43 
 
 
490 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.84 
 
 
472 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  41.36 
 
 
476 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  40.81 
 
 
495 aa  374  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  41.38 
 
 
476 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  40.25 
 
 
477 aa  366  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0093  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  40.04 
 
 
463 aa  358  1.9999999999999998e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325157 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  38.13 
 
 
514 aa  332  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  39.31 
 
 
514 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  39.1 
 
 
514 aa  329  7e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.15 
 
 
478 aa  329  7e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  39.1 
 
 
514 aa  329  9e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  39.1 
 
 
514 aa  329  9e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  39.1 
 
 
514 aa  329  9e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  39.1 
 
 
514 aa  329  9e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  39.1 
 
 
514 aa  329  9e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  35.01 
 
 
502 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  35.2 
 
 
483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  38.9 
 
 
514 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  39.1 
 
 
514 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  36.34 
 
 
502 aa  326  5e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  38.57 
 
 
514 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  36.55 
 
 
480 aa  320  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.1 
 
 
486 aa  312  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  37.99 
 
 
470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.4 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  34.62 
 
 
473 aa  303  5.000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  34.33 
 
 
509 aa  299  8e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  34.13 
 
 
509 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  34.39 
 
 
509 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  34.39 
 
 
509 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  34.39 
 
 
509 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  34.39 
 
 
509 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  34.39 
 
 
509 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  35.27 
 
 
509 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  35.15 
 
 
509 aa  296  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.89 
 
 
508 aa  296  6e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  34.94 
 
 
509 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  37.7 
 
 
486 aa  294  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0911  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.53 
 
 
485 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000528236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.41 
 
 
492 aa  287  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.08 
 
 
483 aa  286  5e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.52 
 
 
498 aa  279  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.54 
 
 
477 aa  271  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  32.03 
 
 
478 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  32.32 
 
 
479 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.04 
 
 
490 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  34.14 
 
 
481 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.11 
 
 
526 aa  264  3e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  33.26 
 
 
479 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  31.31 
 
 
479 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  33.97 
 
 
479 aa  259  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  32.54 
 
 
481 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2033  cardiolipin synthetase  28.84 
 
 
484 aa  254  3e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0028874  hitchhiker  0.0000142083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  31.5 
 
 
490 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  36.83 
 
 
397 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  30.24 
 
 
474 aa  250  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  32.19 
 
 
481 aa  249  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  31.3 
 
 
491 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  31.4 
 
 
490 aa  248  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5524  cardiolipin synthetase domain protein  34.13 
 
 
397 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  31.36 
 
 
479 aa  243  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  31.53 
 
 
479 aa  242  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  30.85 
 
 
489 aa  242  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5477  cardiolipin synthetase domain-containing protein  34.39 
 
 
397 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  33.86 
 
 
397 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  31.53 
 
 
479 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  33.86 
 
 
397 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5195  cardiolipin synthetase domain-containing protein  33.86 
 
 
397 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  33.86 
 
 
397 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.48 
 
 
481 aa  240  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  33.86 
 
 
397 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  31.03 
 
 
480 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  30 
 
 
479 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  31.03 
 
 
484 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  28.92 
 
 
505 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  31.49 
 
 
478 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  30.49 
 
 
483 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  34.74 
 
 
397 aa  237  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4057  cardiolipin synthetase  28.46 
 
 
518 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  30.7 
 
 
441 aa  236  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  28.81 
 
 
476 aa  236  6e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  30.16 
 
 
483 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>