More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0507 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  100 
 
 
479 aa  974    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  52.03 
 
 
480 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  54.08 
 
 
477 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  54.74 
 
 
474 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  52.72 
 
 
477 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  52.06 
 
 
478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  50.31 
 
 
477 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  47.52 
 
 
484 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.15 
 
 
489 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  50 
 
 
477 aa  435  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  49.78 
 
 
472 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.59 
 
 
476 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  45.23 
 
 
481 aa  415  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  49.25 
 
 
502 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  56.46 
 
 
374 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.92 
 
 
483 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.1 
 
 
474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.46 
 
 
464 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.46 
 
 
464 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  43.82 
 
 
476 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.4 
 
 
476 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  39.96 
 
 
484 aa  365  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  42.59 
 
 
476 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  46.79 
 
 
481 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.49 
 
 
472 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  40.99 
 
 
476 aa  350  4e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  39.31 
 
 
500 aa  349  6e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.54 
 
 
472 aa  348  9e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.06 
 
 
474 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  40.84 
 
 
482 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  42.73 
 
 
474 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  42.17 
 
 
474 aa  335  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  41.9 
 
 
486 aa  333  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.16 
 
 
478 aa  333  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  40.43 
 
 
478 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.43 
 
 
478 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.43 
 
 
478 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  40.52 
 
 
467 aa  317  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  39.34 
 
 
486 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  39.14 
 
 
486 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  39.14 
 
 
486 aa  311  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.91 
 
 
487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.65 
 
 
487 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  39.09 
 
 
487 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  38.91 
 
 
482 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  40.21 
 
 
478 aa  297  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  41.51 
 
 
467 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  32.48 
 
 
485 aa  273  5.000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  29.84 
 
 
486 aa  270  5e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.55 
 
 
541 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  31.71 
 
 
502 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  31.29 
 
 
502 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  31.84 
 
 
485 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  35.15 
 
 
474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  31.36 
 
 
490 aa  243  5e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  33.97 
 
 
486 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.72 
 
 
482 aa  237  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.49 
 
 
490 aa  236  9e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.9 
 
 
478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  35.39 
 
 
481 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  31.37 
 
 
478 aa  230  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  32.9 
 
 
477 aa  228  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  28.81 
 
 
481 aa  228  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  31.3 
 
 
514 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.22 
 
 
472 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  26.81 
 
 
476 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  31 
 
 
499 aa  224  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  32.34 
 
 
484 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  34.42 
 
 
478 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  26.13 
 
 
483 aa  223  4.9999999999999996e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  32.11 
 
 
479 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.36 
 
 
485 aa  223  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  32.17 
 
 
441 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  26.77 
 
 
476 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.05 
 
 
483 aa  221  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.26 
 
 
481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  30.02 
 
 
490 aa  221  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  31.74 
 
 
490 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  31.71 
 
 
479 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  31.3 
 
 
514 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  31.24 
 
 
481 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  32.22 
 
 
478 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  28.39 
 
 
488 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  31.36 
 
 
479 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  28.69 
 
 
486 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.2 
 
 
477 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  31.09 
 
 
514 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  30.87 
 
 
514 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  30.45 
 
 
479 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  30.65 
 
 
514 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  30.65 
 
 
514 aa  216  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  30.65 
 
 
514 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  30.65 
 
 
514 aa  216  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  30.65 
 
 
514 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  30.65 
 
 
514 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  30.87 
 
 
514 aa  216  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.81 
 
 
492 aa  216  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.13 
 
 
486 aa  216  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  31.14 
 
 
479 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  31.17 
 
 
479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>