More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1882 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 482 aa  984    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.4 
 
 		 474 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.72 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  44.51 
 
 		 474 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.59 
 
 		 478 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  46.58 
 
 		 502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  46.25 
 
 		 486 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.52 
 
 		 478 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.65 
 
 		 478 aa  398  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  46.52 
 
 		 478 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.51 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  48.02 
 
 		 481 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.2 
 
 		 474 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.72 
 
 		 464 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  44.7 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  40.33 
 
 		 484 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.42 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.23 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.34 
 
 		 474 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  43.97 
 
 		 478 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  42.15 
 
 		 486 aa  363  4e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  42.2 
 
 		 486 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  41.74 
 
 		 486 aa  359  5e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  39.09 
 
 		 500 aa  358  8e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  42.56 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  43.72 
 
 		 476 aa  352  7e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.7 
 
 		 476 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  42.43 
 
 		 478 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  42.95 
 
 		 476 aa  349  7e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.95 
 
 		 476 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  41.58 
 
 		 487 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  41.25 
 
 		 477 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  40.94 
 
 		 477 aa  341  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.04 
 
 		 374 aa  340  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  40.84 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  40.52 
 
 		 484 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  41.2 
 
 		 476 aa  336  5.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  42.89 
 
 		 482 aa  335  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.7 
 
 		 489 aa  333  4e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.54 
 
 		 477 aa  332  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  39.06 
 
 		 481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  40.88 
 
 		 472 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.09 
 
 		 483 aa  319  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  35.56 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.04 
 
 		 472 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  33.55 
 
 		 486 aa  302  9e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  39.26 
 
 		 467 aa  296  7e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.74 
 
 		 477 aa  292  8e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  38.41 
 
 		 474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.62 
 
 		 478 aa  234  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  34.43 
 
 		 471 aa  225  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.59 
 
 		 477 aa  223  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  30.58 
 
 		 485 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  30.62 
 
 		 481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.98 
 
 		 541 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  32.34 
 
 		 477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.96 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.03 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.67 
 
 		 481 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.28 
 
 		 485 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  30.82 
 
 		 490 aa  208  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  29.69 
 
 		 478 aa  208  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.89 
 
 		 482 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  30.06 
 
 		 499 aa  203  5e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  27.47 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  27.47 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.28 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  31.12 
 
 		 479 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  29.16 
 
 		 502 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  27.64 
 
 		 509 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  27.47 
 
 		 509 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  27.47 
 
 		 509 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  28.54 
 
 		 476 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  27.89 
 
 		 509 aa  200  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.55 
 
 		 526 aa  200  5e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  27.27 
 
 		 509 aa  200  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  27.24 
 
 		 509 aa  200  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  31.33 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.98 
 
 		 486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  27.72 
 
 		 509 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0906  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.31 
 
 		 427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.811495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  27.74 
 
 		 488 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  29.54 
 
 		 484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  28.76 
 
 		 502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  31.05 
 
 		 486 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  30.58 
 
 		 479 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  27.52 
 
 		 509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  30.25 
 
 		 474 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  28 
 
 		 476 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  28.51 
 
 		 480 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  26.72 
 
 		 490 aa  194  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  31.86 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  25.36 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  27.56 
 
 		 494 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  27.56 
 
 		 494 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  30.47 
 
 		 489 aa  193  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  30.69 
 
 		 483 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  29.21 
 
 		 514 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  29.37 
 
 		 514 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  31.39 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>