More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1467 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  75 
 
 		 500 aa  772    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 484 aa  1000    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.38 
 
 		 474 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  38 
 
 		 502 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  40.33 
 
 		 482 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.32 
 
 		 464 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.89 
 
 		 464 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  39.32 
 
 		 480 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  39.96 
 
 		 479 aa  365  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  39.71 
 
 		 477 aa  364  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  40.08 
 
 		 485 aa  361  2e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  37.79 
 
 		 476 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.79 
 
 		 476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.69 
 
 		 483 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  37.61 
 
 		 476 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  37.39 
 
 		 476 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  38.59 
 
 		 486 aa  350  3e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.96 
 
 		 478 aa  350  4e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  36.78 
 
 		 478 aa  349  6e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  39.36 
 
 		 478 aa  347  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.88 
 
 		 472 aa  347  4e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.39 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.14 
 
 		 478 aa  344  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.74 
 
 		 476 aa  341  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  40.39 
 
 		 472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.95 
 
 		 478 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.01 
 
 		 477 aa  336  5e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.48 
 
 		 477 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  36.83 
 
 		 474 aa  333  5e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.8 
 
 		 474 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  38.64 
 
 		 486 aa  330  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  38.35 
 
 		 477 aa  330  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  38.76 
 
 		 478 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  36.84 
 
 		 481 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  34.77 
 
 		 481 aa  323  6e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  34.72 
 
 		 484 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  37.89 
 
 		 467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  36.34 
 
 		 486 aa  318  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  38.95 
 
 		 467 aa  316  6e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.43 
 
 		 489 aa  316  8e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  35.93 
 
 		 486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  35.7 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  36.36 
 
 		 482 aa  303  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  36.08 
 
 		 487 aa  300  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.21 
 
 		 374 aa  300  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  33.97 
 
 		 474 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.14 
 
 		 487 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.79 
 
 		 487 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.25 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  29.57 
 
 		 509 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  29.36 
 
 		 509 aa  220  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  29.36 
 
 		 509 aa  220  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  28.94 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  28.94 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  28.94 
 
 		 509 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.35 
 
 		 485 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  28.94 
 
 		 509 aa  216  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  29.25 
 
 		 509 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  29.45 
 
 		 509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  29.66 
 
 		 509 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  29.52 
 
 		 502 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.45 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  28.54 
 
 		 483 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.57 
 
 		 472 aa  210  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.63 
 
 		 541 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.8 
 
 		 483 aa  209  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  29.11 
 
 		 502 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.58 
 
 		 482 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  28.46 
 
 		 480 aa  207  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  28.67 
 
 		 476 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  28.39 
 
 		 490 aa  206  8e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  28.54 
 
 		 483 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  28.95 
 
 		 478 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  28.57 
 
 		 490 aa  204  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  28.67 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  28.66 
 
 		 474 aa  203  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  31.19 
 
 		 471 aa  202  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.03 
 
 		 481 aa  200  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  28.78 
 
 		 499 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  28.48 
 
 		 514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  29.37 
 
 		 514 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  31.41 
 
 		 478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  28.6 
 
 		 514 aa  196  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  29.02 
 
 		 441 aa  196  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  28.4 
 
 		 514 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  28.4 
 
 		 514 aa  196  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  28.45 
 
 		 505 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  28.4 
 
 		 514 aa  196  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  28.4 
 
 		 514 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  28.4 
 
 		 514 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  28.4 
 
 		 514 aa  196  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  28.4 
 
 		 514 aa  196  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.51 
 
 		 477 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  28.4 
 
 		 514 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  28.45 
 
 		 505 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  27.58 
 
 		 490 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  28.07 
 
 		 479 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.85 
 
 		 492 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  33.16 
 
 		 462 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  29.4 
 
 		 479 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>