More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6774 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  65.09 
 
 		 486 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  96.3 
 
 		 487 aa  920    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 487 aa  980    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  64.01 
 
 		 487 aa  650    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  64.68 
 
 		 486 aa  645    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  65.09 
 
 		 486 aa  648    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  61.24 
 
 		 482 aa  580  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  45.23 
 
 		 482 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  44.05 
 
 		 502 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.47 
 
 		 464 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.05 
 
 		 464 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.8 
 
 		 474 aa  346  4e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  40.83 
 
 		 480 aa  340  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.81 
 
 		 474 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  41.63 
 
 		 477 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.34 
 
 		 472 aa  327  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  42.8 
 
 		 481 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  40.5 
 
 		 478 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.51 
 
 		 478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  40 
 
 		 486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.43 
 
 		 483 aa  319  6e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.55 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.25 
 
 		 489 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  39.09 
 
 		 479 aa  317  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  39.09 
 
 		 474 aa  316  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.74 
 
 		 476 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  38.41 
 
 		 481 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.74 
 
 		 478 aa  310  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  38.66 
 
 		 478 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.03 
 
 		 478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  38.46 
 
 		 476 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.11 
 
 		 476 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  38.9 
 
 		 476 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.83 
 
 		 474 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  38.01 
 
 		 484 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  34.79 
 
 		 484 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  38.05 
 
 		 476 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  36.48 
 
 		 477 aa  291  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.19 
 
 		 477 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  40.21 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.71 
 
 		 374 aa  282  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  36.55 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  37.55 
 
 		 472 aa  280  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  33.27 
 
 		 500 aa  276  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.03 
 
 		 472 aa  269  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  33.61 
 
 		 485 aa  259  6e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  30 
 
 		 486 aa  258  2e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  35.22 
 
 		 474 aa  256  7e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  37.77 
 
 		 467 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  30.58 
 
 		 502 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.6 
 
 		 478 aa  213  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  29.48 
 
 		 509 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  29.26 
 
 		 509 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  29.26 
 
 		 502 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  30.46 
 
 		 474 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.94 
 
 		 481 aa  208  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  29.87 
 
 		 509 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  30.09 
 
 		 509 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  29.87 
 
 		 509 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  30.23 
 
 		 509 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  29.89 
 
 		 509 aa  207  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  29.87 
 
 		 509 aa  207  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  29.87 
 
 		 509 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  32.02 
 
 		 478 aa  207  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  31.82 
 
 		 479 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.72 
 
 		 477 aa  206  7e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  33.26 
 
 		 481 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  31.58 
 
 		 485 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  33.42 
 
 		 462 aa  203  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  29.75 
 
 		 509 aa  203  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.38 
 
 		 541 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  32.12 
 
 		 491 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.06 
 
 		 482 aa  200  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  29.85 
 
 		 479 aa  200  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  32.12 
 
 		 490 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  29.54 
 
 		 484 aa  199  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  33.71 
 
 		 481 aa  199  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  31.95 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.26 
 
 		 486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  28.79 
 
 		 476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  29.8 
 
 		 441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  32.1 
 
 		 477 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  32.1 
 
 		 477 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  29.69 
 
 		 479 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  26.92 
 
 		 483 aa  197  5.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  28.51 
 
 		 476 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.75 
 
 		 485 aa  196  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.13 
 
 		 483 aa  195  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  31.74 
 
 		 479 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  31.74 
 
 		 479 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  31.74 
 
 		 479 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  31.74 
 
 		 479 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  33.48 
 
 		 483 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  31.74 
 
 		 479 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  31.74 
 
 		 479 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  29.66 
 
 		 481 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1156  phospholipase D/transphosphatidylase  30.43 
 
 		 441 aa  194  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  28.38 
 
 		 485 aa  194  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  31.61 
 
 		 479 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  30.09 
 
 		 478 aa  193  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>