More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2360 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 
472 aa  981    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.58 
 
 
489 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  50.75 
 
 
481 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  46.9 
 
 
484 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.12 
 
 
476 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  44.89 
 
 
477 aa  386  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.12 
 
 
477 aa  381  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  44.26 
 
 
477 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  44.49 
 
 
479 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  44.54 
 
 
472 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.98 
 
 
474 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  43.18 
 
 
478 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  43.83 
 
 
480 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.04 
 
 
477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.99 
 
 
474 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.14 
 
 
483 aa  332  8e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  41.19 
 
 
502 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.67 
 
 
374 aa  315  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  40.04 
 
 
482 aa  314  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.49 
 
 
478 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  37.11 
 
 
500 aa  310  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  39.03 
 
 
474 aa  310  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.69 
 
 
464 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.69 
 
 
464 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.34 
 
 
472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.9 
 
 
478 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  39.41 
 
 
474 aa  301  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  40.97 
 
 
486 aa  298  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  37.95 
 
 
476 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.92 
 
 
476 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  34.25 
 
 
484 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.77 
 
 
474 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  37.5 
 
 
478 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  38.14 
 
 
476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  37.92 
 
 
476 aa  286  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.29 
 
 
478 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  36.32 
 
 
486 aa  280  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.99 
 
 
487 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  36.11 
 
 
486 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  35.9 
 
 
486 aa  277  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  39.52 
 
 
478 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  39.31 
 
 
481 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.93 
 
 
487 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  36.7 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  37.92 
 
 
467 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  35.79 
 
 
467 aa  266  8e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  32.82 
 
 
486 aa  260  3e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 
487 aa  250  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  33.19 
 
 
485 aa  239  5.999999999999999e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  31.36 
 
 
485 aa  230  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  31.24 
 
 
479 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  32.24 
 
 
477 aa  227  4e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  29.18 
 
 
514 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.5 
 
 
477 aa  223  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.4 
 
 
541 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  31.45 
 
 
479 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  29.01 
 
 
514 aa  223  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  28.98 
 
 
514 aa  223  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  29.18 
 
 
514 aa  222  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  28.98 
 
 
514 aa  222  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  28.98 
 
 
514 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  28.98 
 
 
514 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  28.98 
 
 
514 aa  222  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  28.98 
 
 
514 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  30.99 
 
 
474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  30.75 
 
 
479 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  28.78 
 
 
514 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  28.2 
 
 
514 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  27.44 
 
 
483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  30.4 
 
 
499 aa  212  9e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  30.54 
 
 
479 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  32.64 
 
 
486 aa  212  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  30.75 
 
 
479 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  30.75 
 
 
479 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.75 
 
 
482 aa  211  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  27.66 
 
 
505 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  27.66 
 
 
505 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  30.96 
 
 
479 aa  210  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.85 
 
 
478 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  27.64 
 
 
480 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  30.3 
 
 
478 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  27.12 
 
 
488 aa  203  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  28.93 
 
 
484 aa  203  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  30.13 
 
 
491 aa  203  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  30.72 
 
 
479 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  28.94 
 
 
490 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  30.98 
 
 
481 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.18 
 
 
492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  29.73 
 
 
486 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  29.73 
 
 
486 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  29.73 
 
 
486 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  29.73 
 
 
486 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  29.73 
 
 
486 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  29.47 
 
 
490 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  28.33 
 
 
484 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  25.77 
 
 
490 aa  200  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  28.73 
 
 
502 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  29.9 
 
 
484 aa  200  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  30.66 
 
 
483 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.13 
 
 
486 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>