More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1962 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 
474 aa  948    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  59.15 
 
 
474 aa  524  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  54.68 
 
 
502 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  52.78 
 
 
464 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  52.99 
 
 
464 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  50.74 
 
 
476 aa  430  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  50.53 
 
 
476 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  51.36 
 
 
481 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  46.4 
 
 
482 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  50.32 
 
 
476 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  48.71 
 
 
476 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  47.73 
 
 
478 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.02 
 
 
474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.28 
 
 
478 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  47.1 
 
 
479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  46 
 
 
477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  48.96 
 
 
486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  40.29 
 
 
500 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  40.38 
 
 
484 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  47.77 
 
 
474 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  44.54 
 
 
484 aa  388  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.23 
 
 
489 aa  388  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  44.03 
 
 
480 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.12 
 
 
478 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.64 
 
 
477 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.05 
 
 
483 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.04 
 
 
478 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  45.55 
 
 
477 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  45 
 
 
472 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  45.54 
 
 
472 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  43.62 
 
 
478 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.49 
 
 
476 aa  363  3e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.29 
 
 
477 aa  359  6e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  51.92 
 
 
374 aa  359  7e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  43.28 
 
 
481 aa  351  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  41 
 
 
487 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  44.56 
 
 
478 aa  346  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  42.47 
 
 
486 aa  345  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  43.82 
 
 
467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.95 
 
 
487 aa  343  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  41.46 
 
 
486 aa  342  9e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  41.54 
 
 
486 aa  340  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.73 
 
 
487 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  34.67 
 
 
486 aa  335  7.999999999999999e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  39.92 
 
 
482 aa  328  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  36.23 
 
 
485 aa  325  7e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  42.23 
 
 
467 aa  325  1e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.99 
 
 
472 aa  323  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  39.32 
 
 
474 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.68 
 
 
541 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  32.57 
 
 
502 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  31.93 
 
 
502 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.43 
 
 
478 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.91 
 
 
477 aa  235  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.77 
 
 
481 aa  231  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 
483 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  29.65 
 
 
485 aa  230  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  30.69 
 
 
514 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  30.13 
 
 
514 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  30 
 
 
514 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.59 
 
 
482 aa  226  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  29.92 
 
 
514 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  29.92 
 
 
514 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  33.77 
 
 
486 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  29.92 
 
 
514 aa  225  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  29.92 
 
 
514 aa  225  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  29.92 
 
 
514 aa  225  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  29.92 
 
 
514 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  33.48 
 
 
478 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  29.92 
 
 
514 aa  225  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.98 
 
 
472 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  30.33 
 
 
514 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  31.22 
 
 
484 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.33 
 
 
485 aa  224  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  26.9 
 
 
483 aa  223  7e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.15 
 
 
483 aa  222  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  30.38 
 
 
481 aa  222  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  30.33 
 
 
480 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  30.8 
 
 
490 aa  221  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  33.05 
 
 
483 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.44 
 
 
481 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  27.96 
 
 
509 aa  220  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  27.96 
 
 
509 aa  219  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  28.11 
 
 
509 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  28.16 
 
 
509 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  28.16 
 
 
509 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  27.96 
 
 
509 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  27.96 
 
 
509 aa  217  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  28.16 
 
 
509 aa  217  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  31.36 
 
 
477 aa  217  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  27.96 
 
 
509 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  27.96 
 
 
509 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  30.28 
 
 
499 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.95 
 
 
486 aa  216  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  32.33 
 
 
474 aa  216  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  32.26 
 
 
479 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  35.33 
 
 
475 aa  216  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  32.98 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  32.98 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  32.98 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>