More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2510 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  70.06 
 
 
489 aa  698    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
481 aa  973    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  60.66 
 
 
484 aa  581  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  51.24 
 
 
476 aa  476  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  50.75 
 
 
472 aa  463  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.8 
 
 
477 aa  450  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  51.62 
 
 
472 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  49.68 
 
 
480 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  48.93 
 
 
477 aa  438  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  45.23 
 
 
479 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  47.57 
 
 
477 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.27 
 
 
477 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  47.4 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.19 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.64 
 
 
483 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.28 
 
 
474 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  42.56 
 
 
474 aa  351  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  43.83 
 
 
502 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  43.91 
 
 
486 aa  350  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  41.56 
 
 
476 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.94 
 
 
476 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  50 
 
 
374 aa  343  4e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  42.36 
 
 
476 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  41.27 
 
 
476 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.22 
 
 
464 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  43 
 
 
464 aa  329  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  39.39 
 
 
482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  40.67 
 
 
474 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.3 
 
 
478 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  34.77 
 
 
484 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  34.97 
 
 
500 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.31 
 
 
474 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  40 
 
 
472 aa  322  8e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  37.83 
 
 
486 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.18 
 
 
478 aa  316  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  40.61 
 
 
482 aa  315  8e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  38.45 
 
 
486 aa  315  9e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  38.24 
 
 
486 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  39.49 
 
 
467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  40.86 
 
 
467 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.41 
 
 
487 aa  302  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.21 
 
 
487 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  37.55 
 
 
478 aa  293  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.58 
 
 
478 aa  292  8e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  41.67 
 
 
481 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  39.32 
 
 
478 aa  290  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  36.73 
 
 
487 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  29.69 
 
 
486 aa  271  2e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  31.85 
 
 
502 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  31.57 
 
 
485 aa  251  2e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  31.87 
 
 
502 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  31.75 
 
 
514 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  31.25 
 
 
514 aa  243  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  31.03 
 
 
514 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  31.03 
 
 
514 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  31.03 
 
 
514 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  31.03 
 
 
514 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  31.03 
 
 
514 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  31.53 
 
 
514 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  31.03 
 
 
514 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  31.32 
 
 
514 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  31.1 
 
 
514 aa  239  8e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  30.41 
 
 
485 aa  238  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  29.23 
 
 
483 aa  236  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  29.27 
 
 
509 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  29.49 
 
 
509 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  33.13 
 
 
479 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.48 
 
 
481 aa  233  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.52 
 
 
541 aa  232  9e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  29.27 
 
 
509 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  29.27 
 
 
509 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  29.57 
 
 
509 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  29.27 
 
 
509 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  29.06 
 
 
509 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  29.06 
 
 
509 aa  230  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  32.79 
 
 
479 aa  230  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.12 
 
 
477 aa  229  8e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  32.93 
 
 
479 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  33.91 
 
 
479 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  33.13 
 
 
479 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  34.22 
 
 
481 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  33.95 
 
 
477 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.59 
 
 
472 aa  224  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  28.3 
 
 
509 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  34.22 
 
 
479 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  28.3 
 
 
509 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  32.72 
 
 
474 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  35.09 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  35.09 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  35.09 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  35.09 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  35.09 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  35.09 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  35.09 
 
 
479 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  33.55 
 
 
479 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  32.93 
 
 
479 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  32.93 
 
 
479 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  33.85 
 
 
479 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  32.29 
 
 
478 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.24 
 
 
482 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>