More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0590 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  100 
 
 
484 aa  985    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  62.24 
 
 
489 aa  595  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  60.66 
 
 
481 aa  559  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  51.97 
 
 
476 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  50.21 
 
 
477 aa  483  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  51.39 
 
 
477 aa  477  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  47.52 
 
 
479 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  51.41 
 
 
472 aa  451  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  47.73 
 
 
480 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  48.73 
 
 
477 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.24 
 
 
477 aa  435  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  47.02 
 
 
478 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.9 
 
 
472 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.75 
 
 
474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  43.04 
 
 
474 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.54 
 
 
474 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  44.19 
 
 
502 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.6 
 
 
374 aa  353  5e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.47 
 
 
464 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.05 
 
 
464 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  42.04 
 
 
476 aa  342  7e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.21 
 
 
476 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  40.52 
 
 
482 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  41.1 
 
 
476 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.43 
 
 
483 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  40.33 
 
 
476 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  40.32 
 
 
474 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.31 
 
 
472 aa  331  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.84 
 
 
478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.04 
 
 
478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.43 
 
 
474 aa  322  7e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  40.08 
 
 
486 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  34.72 
 
 
484 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  39.71 
 
 
478 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  34.1 
 
 
500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.71 
 
 
478 aa  320  5e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  39.14 
 
 
486 aa  311  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  41.61 
 
 
481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  38.73 
 
 
486 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  38.93 
 
 
486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.01 
 
 
487 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  37.45 
 
 
482 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  40.17 
 
 
478 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  38.6 
 
 
467 aa  286  5e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.69 
 
 
487 aa  285  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  38.27 
 
 
467 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  32.61 
 
 
486 aa  280  3e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  33.06 
 
 
485 aa  272  1e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  34.16 
 
 
487 aa  262  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  31.89 
 
 
502 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  32.72 
 
 
485 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  32.24 
 
 
502 aa  240  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.71 
 
 
477 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  28.95 
 
 
490 aa  225  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.3 
 
 
478 aa  225  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  32.87 
 
 
477 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  29.55 
 
 
514 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  27.99 
 
 
509 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  32.41 
 
 
481 aa  223  4.9999999999999996e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  29.41 
 
 
514 aa  223  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  31.69 
 
 
484 aa  222  9e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  29.21 
 
 
514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  29.21 
 
 
514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  29.21 
 
 
514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  29.21 
 
 
514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  29.21 
 
 
514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  29.21 
 
 
514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  29.53 
 
 
514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  29.74 
 
 
514 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  29.12 
 
 
514 aa  220  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  27.42 
 
 
509 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  27.57 
 
 
509 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  27.97 
 
 
509 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  29.8 
 
 
505 aa  217  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  27.42 
 
 
509 aa  217  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  29.8 
 
 
505 aa  217  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  28.11 
 
 
509 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  28.11 
 
 
509 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  28.37 
 
 
509 aa  216  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  28.17 
 
 
509 aa  216  9e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  28.17 
 
 
509 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.92 
 
 
481 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.03 
 
 
541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.47 
 
 
472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  29.3 
 
 
490 aa  212  9e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  30.69 
 
 
474 aa  213  9e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  29.54 
 
 
499 aa  212  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.86 
 
 
482 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  31.05 
 
 
484 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  27.68 
 
 
476 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  30.67 
 
 
478 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  28.17 
 
 
488 aa  211  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  27.16 
 
 
476 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  32.44 
 
 
479 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  31.39 
 
 
479 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  31.26 
 
 
481 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  34.84 
 
 
481 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.95 
 
 
483 aa  207  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  26.58 
 
 
483 aa  207  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.75 
 
 
486 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>