More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2878 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  100 
 
 		 482 aa  970    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  61.24 
 
 		 487 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  61.24 
 
 		 487 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  56.82 
 
 		 487 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  54.21 
 
 		 486 aa  534  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  54.04 
 
 		 486 aa  531  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  53.83 
 
 		 486 aa  529  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  43.16 
 
 		 502 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.73 
 
 		 476 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  42.77 
 
 		 476 aa  338  9e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  42.89 
 
 		 482 aa  335  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  42.27 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.01 
 
 		 464 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  42.55 
 
 		 474 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.91 
 
 		 464 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  40.38 
 
 		 476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.92 
 
 		 474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.36 
 
 		 483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  39.88 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.12 
 
 		 478 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  42.46 
 
 		 481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  39.87 
 
 		 477 aa  315  9e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  40.37 
 
 		 486 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  40.61 
 
 		 481 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.89 
 
 		 474 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.67 
 
 		 472 aa  309  8e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  36.38 
 
 		 500 aa  307  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.31 
 
 		 474 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  40.74 
 
 		 478 aa  306  6e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  36.36 
 
 		 484 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.25 
 
 		 477 aa  299  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.34 
 
 		 489 aa  299  8e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.96 
 
 		 476 aa  298  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  38.91 
 
 		 479 aa  297  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  39.78 
 
 		 478 aa  292  8e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.78 
 
 		 478 aa  292  9e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  41.61 
 
 		 467 aa  291  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  41.78 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.28 
 
 		 478 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  37.45 
 
 		 484 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.28 
 
 		 374 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  37.08 
 
 		 477 aa  279  8e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.91 
 
 		 477 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  39.2 
 
 		 478 aa  273  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  36.55 
 
 		 474 aa  265  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  37.5 
 
 		 472 aa  265  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.67 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  32.16 
 
 		 486 aa  249  7e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  33.19 
 
 		 485 aa  246  8e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  32.36 
 
 		 474 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  31.98 
 
 		 484 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  29.6 
 
 		 483 aa  222  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  28.46 
 
 		 502 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  28.78 
 
 		 502 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  34 
 
 		 481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.98 
 
 		 478 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  30.3 
 
 		 514 aa  209  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  30.3 
 
 		 514 aa  209  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  31.33 
 
 		 479 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  30.09 
 
 		 514 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  30.52 
 
 		 514 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  30.09 
 
 		 514 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  28.75 
 
 		 509 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  30.09 
 
 		 514 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  30.09 
 
 		 514 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  30.09 
 
 		 514 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  28.75 
 
 		 509 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  30.09 
 
 		 514 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  28.75 
 
 		 509 aa  207  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  29.05 
 
 		 509 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  28.75 
 
 		 509 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  28.54 
 
 		 509 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  27.61 
 
 		 509 aa  206  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  32.06 
 
 		 479 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  31.67 
 
 		 479 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  31.67 
 
 		 481 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  27.61 
 
 		 509 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  31.18 
 
 		 479 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  28.54 
 
 		 509 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  32.91 
 
 		 479 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  32.77 
 
 		 479 aa  203  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  29.65 
 
 		 514 aa  202  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  29.22 
 
 		 514 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  27.7 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  32.24 
 
 		 481 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  32.04 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  32.07 
 
 		 478 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  32.46 
 
 		 483 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  32.3 
 
 		 462 aa  200  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  32.7 
 
 		 479 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  32.7 
 
 		 479 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  32.7 
 
 		 479 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  32.7 
 
 		 479 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.55 
 
 		 491 aa  199  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  32.7 
 
 		 479 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  32.7 
 
 		 479 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.69 
 
 		 483 aa  199  9e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  31.71 
 
 		 479 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  31.85 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  31.61 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>