More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2125 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 477 aa  974    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  50.21 
 
 		 484 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  50.94 
 
 		 489 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  50.31 
 
 		 479 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  54.37 
 
 		 472 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  50.32 
 
 		 477 aa  456  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  49.8 
 
 		 481 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  49.57 
 
 		 477 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  46.82 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.26 
 
 		 477 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  47.61 
 
 		 478 aa  418  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.5 
 
 		 474 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.79 
 
 		 476 aa  415  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.12 
 
 		 472 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.82 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.29 
 
 		 474 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  51.52 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  42.27 
 
 		 474 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  42.62 
 
 		 502 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  37.01 
 
 		 484 aa  352  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.07 
 
 		 472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.61 
 
 		 464 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.2 
 
 		 464 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  39.67 
 
 		 476 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  36.04 
 
 		 500 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  39.42 
 
 		 476 aa  325  9e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.65 
 
 		 474 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.63 
 
 		 476 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.7 
 
 		 478 aa  319  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  39.5 
 
 		 476 aa  319  7e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.2 
 
 		 478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  38.17 
 
 		 474 aa  309  8e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  40.77 
 
 		 478 aa  308  9e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.75 
 
 		 478 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  37.74 
 
 		 482 aa  299  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  38.4 
 
 		 481 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  38.94 
 
 		 486 aa  293  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  37.76 
 
 		 487 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  39.58 
 
 		 467 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  36.48 
 
 		 486 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.17 
 
 		 487 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  36.07 
 
 		 486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  36.17 
 
 		 486 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.96 
 
 		 487 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  35.91 
 
 		 482 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  37.83 
 
 		 467 aa  276  8e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  39.4 
 
 		 478 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  31.21 
 
 		 486 aa  261  3e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  34.12 
 
 		 485 aa  260  4e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.97 
 
 		 477 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  30.56 
 
 		 485 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  28.87 
 
 		 483 aa  233  4.0000000000000004e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  30 
 
 		 502 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  29.48 
 
 		 476 aa  226  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  31.34 
 
 		 486 aa  224  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  29.48 
 
 		 476 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  30.64 
 
 		 490 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  31.26 
 
 		 499 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.16 
 
 		 485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  31.18 
 
 		 477 aa  221  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.54 
 
 		 492 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  30.43 
 
 		 502 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.31 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  28.7 
 
 		 488 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.98 
 
 		 483 aa  212  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  29.56 
 
 		 514 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.52 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  29.35 
 
 		 514 aa  211  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  29.35 
 
 		 514 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 		 479 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  29.35 
 
 		 514 aa  210  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  29.35 
 
 		 514 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  29.35 
 
 		 514 aa  210  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  29.35 
 
 		 514 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  29.35 
 
 		 514 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  31.55 
 
 		 490 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  31.48 
 
 		 490 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  33.54 
 
 		 479 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  27.92 
 
 		 481 aa  208  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  28.7 
 
 		 494 aa  206  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.33 
 
 		 481 aa  206  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  28.7 
 
 		 494 aa  206  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  29.14 
 
 		 514 aa  206  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  28.93 
 
 		 514 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  29.14 
 
 		 514 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  29.92 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.5 
 
 		 490 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  25.49 
 
 		 483 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.86 
 
 		 478 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.33 
 
 		 541 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  28.81 
 
 		 487 aa  204  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  25.27 
 
 		 483 aa  202  9e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  31.3 
 
 		 479 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  31.6 
 
 		 479 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  31.6 
 
 		 479 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  29.65 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  29.25 
 
 		 478 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 		 480 aa  200  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  31.02 
 
 		 478 aa  199  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  30.13 
 
 		 484 aa  199  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>