More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0386 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
467 aa  954    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  56.77 
 
 
476 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  56.13 
 
 
476 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  56.56 
 
 
476 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  55.91 
 
 
476 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  40.92 
 
 
502 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.21 
 
 
474 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  40.92 
 
 
478 aa  343  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.33 
 
 
483 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.04 
 
 
464 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  41.14 
 
 
480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.83 
 
 
464 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  39.87 
 
 
479 aa  335  9e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  40.6 
 
 
477 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  38.66 
 
 
484 aa  335  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.47 
 
 
474 aa  332  6e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  38.35 
 
 
500 aa  332  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  38.35 
 
 
481 aa  323  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.5 
 
 
489 aa  316  4e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  40.9 
 
 
486 aa  316  5e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  40.92 
 
 
472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  41.53 
 
 
467 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.57 
 
 
478 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  40.08 
 
 
481 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  38.76 
 
 
474 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  38.99 
 
 
482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  40.86 
 
 
482 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.35 
 
 
476 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.35 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.13 
 
 
477 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  37.5 
 
 
484 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.73 
 
 
374 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  36.65 
 
 
485 aa  296  8e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  39.17 
 
 
477 aa  292  8e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  37.9 
 
 
478 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.1 
 
 
478 aa  289  8e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.17 
 
 
472 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.69 
 
 
478 aa  286  8e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.98 
 
 
477 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  39.35 
 
 
478 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  36.48 
 
 
474 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  37.45 
 
 
487 aa  276  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  36.76 
 
 
486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  36.55 
 
 
486 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.08 
 
 
472 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  32.83 
 
 
486 aa  267  2e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  37.23 
 
 
486 aa  266  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.18 
 
 
487 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.74 
 
 
487 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.19 
 
 
481 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  30.69 
 
 
499 aa  221  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  34.17 
 
 
478 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  30.32 
 
 
490 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  29.73 
 
 
481 aa  214  2.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.27 
 
 
482 aa  213  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  30.1 
 
 
490 aa  213  7.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  27.85 
 
 
476 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  30.39 
 
 
505 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  30.39 
 
 
505 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  29.41 
 
 
502 aa  209  9e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  30.43 
 
 
484 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.45 
 
 
472 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.46 
 
 
483 aa  207  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.85 
 
 
477 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.35 
 
 
478 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  31 
 
 
483 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  29.91 
 
 
514 aa  207  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  28.9 
 
 
509 aa  206  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  27.63 
 
 
476 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  28.06 
 
 
509 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  27.35 
 
 
483 aa  204  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  28.33 
 
 
502 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  28.29 
 
 
509 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  27.85 
 
 
509 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  28.6 
 
 
480 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.61 
 
 
541 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.25 
 
 
485 aa  203  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  28.27 
 
 
509 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  28.27 
 
 
509 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  28.27 
 
 
509 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  28.27 
 
 
509 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  28.06 
 
 
509 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  29.64 
 
 
514 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  29.42 
 
 
514 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  29.42 
 
 
514 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  29.42 
 
 
514 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  29.42 
 
 
514 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  29.42 
 
 
514 aa  201  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  29.42 
 
 
514 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  28.06 
 
 
509 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  29.21 
 
 
514 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  31.87 
 
 
486 aa  200  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  31.87 
 
 
483 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  29.21 
 
 
514 aa  200  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  29.94 
 
 
485 aa  199  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  29.21 
 
 
514 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  32.48 
 
 
471 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  29.77 
 
 
477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  30.27 
 
 
479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  32.01 
 
 
481 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>