More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5389 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 
477 aa  971    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  55.46 
 
 
480 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  55.7 
 
 
477 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  52.72 
 
 
479 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  52.1 
 
 
478 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  47.24 
 
 
484 aa  448  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  51.2 
 
 
472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  51.27 
 
 
489 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  50.54 
 
 
474 aa  433  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.26 
 
 
477 aa  432  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  47.86 
 
 
481 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  49.04 
 
 
477 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.75 
 
 
476 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.04 
 
 
483 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.64 
 
 
474 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  46.25 
 
 
502 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  53.21 
 
 
374 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.07 
 
 
464 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.3 
 
 
464 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  43.51 
 
 
476 aa  363  4e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.82 
 
 
476 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  43.42 
 
 
486 aa  359  6e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  43.82 
 
 
476 aa  359  7e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.36 
 
 
472 aa  356  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  43.19 
 
 
476 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  38.48 
 
 
484 aa  353  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  39.54 
 
 
500 aa  352  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.78 
 
 
474 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  44.61 
 
 
481 aa  349  7e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  41.67 
 
 
482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.03 
 
 
472 aa  340  4e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  40.12 
 
 
474 aa  329  6e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.12 
 
 
478 aa  329  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  41.75 
 
 
474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.23 
 
 
478 aa  318  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.96 
 
 
487 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  38.65 
 
 
487 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.65 
 
 
487 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  41.81 
 
 
478 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  38.77 
 
 
486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.53 
 
 
478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  40.25 
 
 
482 aa  307  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  38.61 
 
 
486 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  38.4 
 
 
486 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  39.74 
 
 
467 aa  295  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  39.88 
 
 
478 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  38.4 
 
 
467 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  31.19 
 
 
486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  32.56 
 
 
485 aa  269  8e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  33.61 
 
 
477 aa  230  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  35.26 
 
 
481 aa  229  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  33.69 
 
 
478 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  26.76 
 
 
483 aa  226  5.0000000000000005e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  27.66 
 
 
476 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.27 
 
 
486 aa  223  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  29.57 
 
 
514 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  29.88 
 
 
480 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.22 
 
 
478 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  29.36 
 
 
514 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  29.36 
 
 
514 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  29.36 
 
 
514 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  29.36 
 
 
514 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  29.36 
 
 
514 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  29.36 
 
 
514 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  31.76 
 
 
499 aa  220  5e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  33.61 
 
 
479 aa  220  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  32.15 
 
 
483 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  29.16 
 
 
514 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  32.71 
 
 
479 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  30.43 
 
 
502 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  30.83 
 
 
481 aa  217  2.9999999999999998e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  30.04 
 
 
514 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  27.76 
 
 
509 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  27.96 
 
 
509 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.53 
 
 
477 aa  216  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  32.06 
 
 
486 aa  216  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.46 
 
 
481 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  28.66 
 
 
514 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  31.47 
 
 
479 aa  216  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  33.61 
 
 
491 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  27.55 
 
 
509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  27.55 
 
 
509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  27.55 
 
 
509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  27.55 
 
 
509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  27.39 
 
 
476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  27.35 
 
 
509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  27.35 
 
 
509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  29.04 
 
 
514 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  33.12 
 
 
490 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  32.22 
 
 
484 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.46 
 
 
485 aa  213  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  30.15 
 
 
502 aa  213  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  33.26 
 
 
490 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  30.25 
 
 
485 aa  212  9e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  32.78 
 
 
479 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  34.23 
 
 
479 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  31.94 
 
 
483 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.74 
 
 
492 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  32.29 
 
 
479 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  31.22 
 
 
479 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>