More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1682 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
474 aa  956    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  43.04 
 
 
484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  42.58 
 
 
477 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.07 
 
 
476 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.27 
 
 
477 aa  360  2e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  43.1 
 
 
481 aa  350  3e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  41.42 
 
 
477 aa  346  4e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.03 
 
 
489 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  42.17 
 
 
479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  40.71 
 
 
480 aa  336  5e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  42.05 
 
 
472 aa  335  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  38.76 
 
 
478 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.54 
 
 
477 aa  327  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.83 
 
 
474 aa  322  8e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.22 
 
 
483 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.32 
 
 
474 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  35.86 
 
 
500 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  41.25 
 
 
502 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.41 
 
 
472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  39.52 
 
 
476 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  33.97 
 
 
484 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.52 
 
 
476 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  39.7 
 
 
476 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.78 
 
 
474 aa  295  9e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  39.31 
 
 
476 aa  295  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.04 
 
 
464 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.82 
 
 
464 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.6 
 
 
374 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.39 
 
 
472 aa  289  7e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  38.41 
 
 
482 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  38.56 
 
 
486 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  39.57 
 
 
474 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.45 
 
 
478 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  37.58 
 
 
467 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  36.55 
 
 
486 aa  268  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  39.29 
 
 
467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  36.55 
 
 
482 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  39.17 
 
 
481 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  36.49 
 
 
486 aa  265  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  36.13 
 
 
486 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  37.42 
 
 
478 aa  264  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.42 
 
 
478 aa  263  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  36.31 
 
 
487 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.97 
 
 
478 aa  259  7e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  38.25 
 
 
478 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  34.17 
 
 
485 aa  256  5e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.03 
 
 
487 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  30.64 
 
 
486 aa  251  3e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.89 
 
 
487 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.45 
 
 
472 aa  192  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.45 
 
 
483 aa  192  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.21 
 
 
477 aa  190  5.999999999999999e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  28.35 
 
 
509 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  28.14 
 
 
509 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  27.16 
 
 
502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  27.92 
 
 
509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  27.92 
 
 
509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  27.92 
 
 
509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  29.33 
 
 
490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  27.92 
 
 
509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  27.71 
 
 
509 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.16 
 
 
478 aa  183  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.41 
 
 
485 aa  182  8.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  27.92 
 
 
502 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  27.71 
 
 
509 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  28.14 
 
 
509 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  27.64 
 
 
474 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  28.14 
 
 
509 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  26.7 
 
 
476 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  28.82 
 
 
478 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  28.31 
 
 
490 aa  180  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  28.12 
 
 
481 aa  180  5.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  28.81 
 
 
514 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  30.07 
 
 
486 aa  179  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  27.51 
 
 
481 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  28.81 
 
 
514 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  28.81 
 
 
514 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  28.81 
 
 
514 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  28.81 
 
 
514 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  27.68 
 
 
479 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.97 
 
 
472 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  28.81 
 
 
514 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  28.81 
 
 
514 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  28.81 
 
 
514 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  26.26 
 
 
476 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.32 
 
 
492 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  25.1 
 
 
483 aa  178  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.41 
 
 
486 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  28.83 
 
 
479 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  27.51 
 
 
479 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  27.1 
 
 
485 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  29.21 
 
 
514 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  28.45 
 
 
483 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  28.6 
 
 
514 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  28.17 
 
 
490 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  28.17 
 
 
491 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.89 
 
 
526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  28.77 
 
 
514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  31.41 
 
 
472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  28.63 
 
 
483 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>