More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3949 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  73.12 
 
 		 467 aa  692    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  75 
 
 		 472 aa  707    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  73.33 
 
 		 467 aa  695    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 472 aa  952    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  45.34 
 
 		 489 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  45.28 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08050  cardiolipin synthetase 2  38.26 
 
 		 495 aa  300  5e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.79 
 
 		 491 aa  298  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.72 
 
 		 481 aa  297  4e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.81 
 
 		 479 aa  294  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  40.25 
 
 		 491 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  34.4 
 
 		 492 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.3 
 
 		 467 aa  267  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  33.75 
 
 		 486 aa  263  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  34.04 
 
 		 486 aa  261  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  32.84 
 
 		 486 aa  261  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  33.4 
 
 		 486 aa  259  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  33.4 
 
 		 486 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  33.4 
 
 		 486 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  33.12 
 
 		 486 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  32.22 
 
 		 486 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  32.22 
 
 		 486 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  32.22 
 
 		 486 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  32.22 
 
 		 486 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  32.22 
 
 		 486 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  34.1 
 
 		 486 aa  249  9e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  34.24 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 		 484 aa  248  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  32.49 
 
 		 486 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.49 
 
 		 486 aa  247  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  32.49 
 
 		 486 aa  247  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  32.49 
 
 		 486 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  32.49 
 
 		 486 aa  247  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  32.49 
 
 		 486 aa  247  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  32.49 
 
 		 486 aa  247  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  31.92 
 
 		 486 aa  246  6.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  32.49 
 
 		 486 aa  246  6.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  30.5 
 
 		 483 aa  245  9.999999999999999e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  32.08 
 
 		 484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  32.08 
 
 		 486 aa  244  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  32.33 
 
 		 484 aa  243  6e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  30.15 
 
 		 476 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  31.59 
 
 		 485 aa  240  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  32.77 
 
 		 471 aa  240  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  29.93 
 
 		 476 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  31.6 
 
 		 485 aa  239  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.97 
 
 		 541 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  31.75 
 
 		 490 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.53 
 
 		 482 aa  236  6e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  31.57 
 
 		 502 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  31.24 
 
 		 479 aa  230  4e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  31.46 
 
 		 479 aa  230  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  32.06 
 
 		 532 aa  229  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  30.35 
 
 		 484 aa  229  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  33.7 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  35.71 
 
 		 481 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  32.84 
 
 		 491 aa  227  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  34.63 
 
 		 475 aa  227  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  32.64 
 
 		 492 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  30.85 
 
 		 502 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  32.11 
 
 		 484 aa  223  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.72 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  30.07 
 
 		 514 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  30.07 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  30.72 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  30.28 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  27.38 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  30.07 
 
 		 514 aa  217  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  30.07 
 
 		 514 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  30.07 
 
 		 514 aa  217  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  30.07 
 
 		 514 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  30.07 
 
 		 514 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  30.28 
 
 		 514 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.31 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  29.89 
 
 		 514 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  30.79 
 
 		 473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  29.66 
 
 		 555 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  32.06 
 
 		 479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  32.31 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1551  cardiolipin synthetase  29.19 
 
 		 547 aa  212  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970599  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.27 
 
 		 498 aa  212  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.89 
 
 		 486 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  31 
 
 		 485 aa  211  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  31.28 
 
 		 479 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  33.27 
 
 		 478 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  32.36 
 
 		 479 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.85 
 
 		 485 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  27.73 
 
 		 509 aa  210  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  28.6 
 
 		 509 aa  209  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  27.66 
 
 		 490 aa  209  7e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  36.07 
 
 		 482 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  28.6 
 
 		 509 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  28.6 
 
 		 509 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  28.6 
 
 		 509 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  31.07 
 
 		 479 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  28.39 
 
 		 509 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  34.61 
 
 		 474 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  31.05 
 
 		 481 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  27.73 
 
 		 509 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  32.04 
 
 		 474 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>