More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1390 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  100 
 
 		 492 aa  1008    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  75.51 
 
 		 491 aa  788    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  41.8 
 
 		 486 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  41.96 
 
 		 486 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  41.89 
 
 		 486 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  41.68 
 
 		 486 aa  395  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  41.8 
 
 		 486 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  41.8 
 
 		 486 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  41.89 
 
 		 486 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  41.89 
 
 		 486 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  41.8 
 
 		 486 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  41.8 
 
 		 486 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  41.68 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.68 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  41.68 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  44.33 
 
 		 484 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  41.68 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  41.68 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  41.68 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  41.48 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  41.68 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  41.32 
 
 		 486 aa  392  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  41.14 
 
 		 486 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  40.84 
 
 		 490 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  41.49 
 
 		 483 aa  387  1e-106  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  40.24 
 
 		 532 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  41.2 
 
 		 486 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  40.12 
 
 		 486 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  40.12 
 
 		 486 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  41.37 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  40.64 
 
 		 485 aa  364  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  40.33 
 
 		 484 aa  360  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  41.26 
 
 		 484 aa  359  5e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  38.87 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  39.96 
 
 		 484 aa  354  2.9999999999999997e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  38.33 
 
 		 492 aa  351  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1551  cardiolipin synthetase  34.87 
 
 		 547 aa  316  6e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970599  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  34.67 
 
 		 555 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  35.49 
 
 		 478 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  35.24 
 
 		 479 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  35.62 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  34.37 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  34.08 
 
 		 481 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.47 
 
 		 491 aa  250  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.4 
 
 		 481 aa  246  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  32.83 
 
 		 489 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  33.88 
 
 		 475 aa  233  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  32.62 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.28 
 
 		 485 aa  230  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  33.26 
 
 		 471 aa  229  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  29.98 
 
 		 502 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.26 
 
 		 477 aa  223  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  29.67 
 
 		 490 aa  223  6e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.21 
 
 		 479 aa  220  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  31.33 
 
 		 473 aa  219  7e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  31.19 
 
 		 467 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  31.55 
 
 		 467 aa  217  4e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  28.48 
 
 		 483 aa  217  5e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.04 
 
 		 541 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  29.72 
 
 		 502 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.82 
 
 		 481 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.28 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.61 
 
 		 482 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0934  phospholipase D/transphosphatidylase  28.84 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.22 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08050  cardiolipin synthetase 2  30.57 
 
 		 495 aa  211  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  32.5 
 
 		 478 aa  210  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  31.91 
 
 		 491 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.64 
 
 		 472 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  28.25 
 
 		 481 aa  208  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  27.45 
 
 		 505 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  27.45 
 
 		 505 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  33.05 
 
 		 472 aa  207  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.45 
 
 		 498 aa  206  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  27.44 
 
 		 487 aa  206  7e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  29.86 
 
 		 484 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1793  phospholipase D/transphosphatidylase  27.91 
 
 		 497 aa  203  6e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.11 
 
 		 483 aa  202  9e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  30.35 
 
 		 480 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  29.87 
 
 		 502 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.65 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  29.98 
 
 		 477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.39 
 
 		 474 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.41 
 
 		 467 aa  197  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  29.81 
 
 		 486 aa  197  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  28.23 
 
 		 488 aa  196  8.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  27.92 
 
 		 476 aa  196  9e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.66 
 
 		 526 aa  196  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.07 
 
 		 486 aa  196  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  27.71 
 
 		 476 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.03 
 
 		 495 aa  194  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  29.04 
 
 		 514 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  29.2 
 
 		 509 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  29.2 
 
 		 509 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  28.83 
 
 		 514 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.79 
 
 		 487 aa  193  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  28.83 
 
 		 514 aa  192  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  28.83 
 
 		 514 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  28.83 
 
 		 514 aa  192  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  28.83 
 
 		 514 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>