More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2240 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  65.36 
 
 		 485 aa  675    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  65.98 
 
 		 490 aa  686    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  100 
 
 		 485 aa  1001    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  67.63 
 
 		 484 aa  673    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  60.12 
 
 		 532 aa  632  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  58.14 
 
 		 484 aa  590  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  56.7 
 
 		 484 aa  587  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  58.35 
 
 		 484 aa  586  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  57.53 
 
 		 484 aa  584  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  50.82 
 
 		 486 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  50.82 
 
 		 486 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  50.82 
 
 		 486 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  50.62 
 
 		 486 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  50 
 
 		 486 aa  502  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  50.21 
 
 		 486 aa  501  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  50 
 
 		 486 aa  500  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  48.87 
 
 		 486 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.87 
 
 		 486 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  48.87 
 
 		 486 aa  492  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  48.87 
 
 		 486 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  48.87 
 
 		 486 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  48.87 
 
 		 486 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  48.87 
 
 		 486 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  48.87 
 
 		 486 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  48.67 
 
 		 486 aa  491  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  48.15 
 
 		 486 aa  488  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  47.53 
 
 		 486 aa  485  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  47.84 
 
 		 486 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  47.84 
 
 		 486 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  47.84 
 
 		 486 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  47.84 
 
 		 486 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  47.84 
 
 		 486 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  49.26 
 
 		 483 aa  466  9.999999999999999e-131  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  47.15 
 
 		 492 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  41.19 
 
 		 491 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  38.87 
 
 		 492 aa  354  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1551  cardiolipin synthetase  36.45 
 
 		 547 aa  336  5.999999999999999e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970599  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  36.33 
 
 		 555 aa  333  5e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  33.12 
 
 		 479 aa  256  8e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  32.36 
 
 		 479 aa  252  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  34.65 
 
 		 471 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  33.89 
 
 		 475 aa  242  9e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  34.34 
 
 		 481 aa  240  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  32.42 
 
 		 478 aa  239  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  32.69 
 
 		 478 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.06 
 
 		 482 aa  233  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.43 
 
 		 483 aa  230  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  32.57 
 
 		 467 aa  229  8e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  32.57 
 
 		 467 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  35 
 
 		 502 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  32.29 
 
 		 472 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  29.54 
 
 		 489 aa  224  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  31.09 
 
 		 482 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.53 
 
 		 478 aa  223  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  32.42 
 
 		 514 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  32.91 
 
 		 514 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  32.14 
 
 		 514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  31.92 
 
 		 514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  31.92 
 
 		 514 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  31.92 
 
 		 514 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  31.92 
 
 		 514 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  31.92 
 
 		 514 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  31.92 
 
 		 514 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.25 
 
 		 485 aa  220  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.29 
 
 		 479 aa  219  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  31.36 
 
 		 499 aa  218  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.36 
 
 		 481 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  32.28 
 
 		 514 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.29 
 
 		 491 aa  216  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  32.28 
 
 		 514 aa  216  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  33.4 
 
 		 491 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  29.9 
 
 		 509 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  31.86 
 
 		 502 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.13 
 
 		 481 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  30.04 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  30.13 
 
 		 476 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  29.7 
 
 		 509 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  31.34 
 
 		 488 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08050  cardiolipin synthetase 2  29.67 
 
 		 495 aa  207  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  29.38 
 
 		 509 aa  206  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  28.6 
 
 		 509 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  28.4 
 
 		 509 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  28.6 
 
 		 509 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  28.4 
 
 		 509 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  28.4 
 
 		 509 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.33 
 
 		 508 aa  204  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.44 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  29.08 
 
 		 509 aa  203  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  27.85 
 
 		 473 aa  202  9e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  28.86 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.75 
 
 		 467 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  29.39 
 
 		 483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.68 
 
 		 487 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  29.26 
 
 		 484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  30.38 
 
 		 502 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  31.16 
 
 		 477 aa  200  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  29.61 
 
 		 481 aa  199  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.39 
 
 		 464 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  31 
 
 		 472 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.84 
 
 		 495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>