More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4114 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 467 aa  941    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.15 
 
 		 479 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  51.37 
 
 		 491 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  48.5 
 
 		 491 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08050  cardiolipin synthetase 2  46.45 
 
 		 495 aa  382  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  38.12 
 
 		 489 aa  266  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  39.65 
 
 		 472 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.3 
 
 		 472 aa  265  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.58 
 
 		 481 aa  259  7e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  38.25 
 
 		 478 aa  249  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  34.42 
 
 		 484 aa  246  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  36.74 
 
 		 467 aa  246  6e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  36.74 
 
 		 467 aa  246  8e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  32.03 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  32.07 
 
 		 492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  31.84 
 
 		 555 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  33.76 
 
 		 502 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  32.39 
 
 		 484 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  31.39 
 
 		 486 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  31.59 
 
 		 484 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  30.67 
 
 		 532 aa  227  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  31.75 
 
 		 485 aa  227  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1551  cardiolipin synthetase  30.91 
 
 		 547 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970599  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  30.94 
 
 		 484 aa  226  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  30.89 
 
 		 490 aa  226  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  33.03 
 
 		 486 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  33.03 
 
 		 486 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  33.03 
 
 		 486 aa  224  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  32.97 
 
 		 484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  32.2 
 
 		 486 aa  221  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  34.92 
 
 		 475 aa  220  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  29.78 
 
 		 483 aa  219  6e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  31.06 
 
 		 502 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  30.42 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  31.52 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  30.42 
 
 		 486 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  32.41 
 
 		 492 aa  216  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  31.57 
 
 		 514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  32.41 
 
 		 491 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  31.36 
 
 		 514 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  32.26 
 
 		 474 aa  213  9e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  31.14 
 
 		 514 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  31.14 
 
 		 514 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  31.14 
 
 		 514 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  31.14 
 
 		 514 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  31.14 
 
 		 514 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  31.14 
 
 		 514 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  30.93 
 
 		 514 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  30.79 
 
 		 486 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  30.79 
 
 		 486 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  30.79 
 
 		 486 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  30.79 
 
 		 486 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  30.79 
 
 		 486 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  30.93 
 
 		 514 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  32.54 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  30.72 
 
 		 514 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  33.55 
 
 		 479 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  30.34 
 
 		 486 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  32.09 
 
 		 471 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  28.67 
 
 		 486 aa  203  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  33.41 
 
 		 490 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  29.15 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  29.15 
 
 		 486 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.15 
 
 		 486 aa  201  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  29.15 
 
 		 486 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  29.15 
 
 		 486 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  29.15 
 
 		 486 aa  201  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.98 
 
 		 483 aa  201  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  29.15 
 
 		 486 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  29.15 
 
 		 486 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  32.96 
 
 		 479 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  34.47 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  35.56 
 
 		 481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  30.71 
 
 		 485 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  34.96 
 
 		 502 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  34.63 
 
 		 491 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  34.63 
 
 		 490 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.24 
 
 		 492 aa  196  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  29.83 
 
 		 509 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  33.56 
 
 		 479 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  35.38 
 
 		 481 aa  196  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 		 481 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  28.87 
 
 		 509 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.77 
 
 		 541 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.48 
 
 		 485 aa  195  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  26.5 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.97 
 
 		 490 aa  193  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  33.11 
 
 		 479 aa  193  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  28.96 
 
 		 509 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  28.96 
 
 		 509 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  34.32 
 
 		 479 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  31.81 
 
 		 489 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  29.41 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  35.62 
 
 		 481 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  28.75 
 
 		 509 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 		 483 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  28.54 
 
 		 509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  28.54 
 
 		 509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.39 
 
 		 481 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  32.43 
 
 		 479 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>