More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03233 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  76.02 
 
 
467 aa  719    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  100 
 
 
472 aa  948    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  75 
 
 
472 aa  708    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  76.23 
 
 
467 aa  721    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  45.78 
 
 
489 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  43.52 
 
 
478 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.62 
 
 
479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.46 
 
 
491 aa  294  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08050  cardiolipin synthetase 2  38.38 
 
 
495 aa  293  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  38.98 
 
 
491 aa  284  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.94 
 
 
481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  34.61 
 
 
486 aa  259  7e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  33.76 
 
 
486 aa  257  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.65 
 
 
467 aa  253  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  33.97 
 
 
486 aa  252  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  33.97 
 
 
486 aa  252  8.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  33.97 
 
 
486 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  33.12 
 
 
492 aa  249  7e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  33.05 
 
 
486 aa  249  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 
486 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  32.78 
 
 
485 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  34.82 
 
 
478 aa  247  4e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  34.38 
 
 
475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  33.05 
 
 
490 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  33.4 
 
 
532 aa  243  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  34.04 
 
 
471 aa  243  6e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  33.26 
 
 
486 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  33.26 
 
 
486 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  32.7 
 
 
486 aa  243  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  33.26 
 
 
486 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  33.26 
 
 
486 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  33.26 
 
 
486 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  32 
 
 
486 aa  236  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  29.4 
 
 
483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  32.57 
 
 
484 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  36.85 
 
 
481 aa  234  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  32.84 
 
 
486 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.84 
 
 
486 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  32.84 
 
 
486 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  32.84 
 
 
486 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  32.84 
 
 
486 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  32.84 
 
 
486 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  30.45 
 
 
485 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  32.84 
 
 
486 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  30.83 
 
 
502 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  32.84 
 
 
486 aa  233  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  30.57 
 
 
476 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  30.85 
 
 
484 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  31.66 
 
 
484 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.42 
 
 
541 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  31.01 
 
 
484 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  32.41 
 
 
486 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  29.98 
 
 
514 aa  229  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  32.29 
 
 
485 aa  229  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  30.19 
 
 
514 aa  229  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  33.04 
 
 
484 aa  228  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.14 
 
 
472 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  29.98 
 
 
514 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  29.77 
 
 
514 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  29.77 
 
 
514 aa  226  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  29.77 
 
 
514 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  29.77 
 
 
514 aa  226  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  29.77 
 
 
514 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  29.77 
 
 
514 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  29.5 
 
 
476 aa  226  7e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  32.68 
 
 
480 aa  226  8e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  29.77 
 
 
514 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  29.68 
 
 
514 aa  223  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  31.92 
 
 
491 aa  222  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  30.57 
 
 
502 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.35 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  31.31 
 
 
479 aa  219  8.999999999999998e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  33.05 
 
 
492 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  30.41 
 
 
479 aa  218  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  33.26 
 
 
486 aa  217  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  30.79 
 
 
473 aa  216  7e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  30.58 
 
 
474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  34.44 
 
 
482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  33.56 
 
 
484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  26.68 
 
 
486 aa  213  4.9999999999999996e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.91 
 
 
485 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  33.11 
 
 
482 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  27.35 
 
 
509 aa  210  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  34.74 
 
 
502 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  26.99 
 
 
509 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  26.99 
 
 
509 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  32.65 
 
 
481 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.98 
 
 
477 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  27.14 
 
 
509 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  35.18 
 
 
474 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.97 
 
 
508 aa  208  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  26.57 
 
 
509 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  26.78 
 
 
509 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  26.26 
 
 
509 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  26.57 
 
 
509 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  32.43 
 
 
479 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.63 
 
 
464 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  26.26 
 
 
509 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  28.7 
 
 
490 aa  207  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.38 
 
 
495 aa  207  3e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>