More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1113 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 478 aa  989    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  70.77 
 
 		 479 aa  731    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  71.19 
 
 		 479 aa  739    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  51.28 
 
 		 482 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  46.54 
 
 		 481 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  40.17 
 
 		 475 aa  359  5e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  36.25 
 
 		 486 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  34.38 
 
 		 486 aa  285  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  34.38 
 
 		 486 aa  285  9e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  35.8 
 
 		 486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  34.38 
 
 		 486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  35.49 
 
 		 492 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  35.8 
 
 		 486 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  34.5 
 
 		 486 aa  282  8.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  35.22 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  35.22 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  35.22 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  35.06 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  35.22 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  35.22 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  34.5 
 
 		 486 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.5 
 
 		 486 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  34.5 
 
 		 486 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  34.5 
 
 		 486 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  34.5 
 
 		 486 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  34.5 
 
 		 486 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  34.5 
 
 		 486 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  34.51 
 
 		 486 aa  279  8e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  34.5 
 
 		 486 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  36.12 
 
 		 491 aa  276  5e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  35.02 
 
 		 489 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  34.09 
 
 		 486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  33.87 
 
 		 483 aa  274  2.0000000000000002e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  33.88 
 
 		 484 aa  263  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  33.05 
 
 		 484 aa  262  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  32.78 
 
 		 492 aa  258  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  33.88 
 
 		 485 aa  256  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  33.05 
 
 		 484 aa  256  5e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  32.21 
 
 		 484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  34.37 
 
 		 478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  32.21 
 
 		 490 aa  253  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  31.59 
 
 		 532 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  35.15 
 
 		 472 aa  244  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  33.68 
 
 		 467 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  32.42 
 
 		 485 aa  239  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  33.4 
 
 		 471 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  31.7 
 
 		 509 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  31.7 
 
 		 509 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  33.47 
 
 		 467 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  31.49 
 
 		 509 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.88 
 
 		 472 aa  236  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.01 
 
 		 478 aa  236  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  31.29 
 
 		 509 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  32.39 
 
 		 509 aa  236  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  31.08 
 
 		 509 aa  236  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  31.29 
 
 		 509 aa  236  8e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  31.49 
 
 		 509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  31.73 
 
 		 484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  32.79 
 
 		 509 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  31.25 
 
 		 555 aa  233  7.000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  30.88 
 
 		 509 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1551  cardiolipin synthetase  31.11 
 
 		 547 aa  230  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970599  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  32.75 
 
 		 502 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.11 
 
 		 477 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.69 
 
 		 485 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  32.43 
 
 		 514 aa  226  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  33.41 
 
 		 484 aa  226  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  32.22 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  32.22 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  32.22 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  32.22 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  31.32 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  32.22 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  32.22 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  32.22 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  32.02 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  32.32 
 
 		 502 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  31.46 
 
 		 514 aa  224  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.02 
 
 		 483 aa  219  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  32.67 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  32.87 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  32.18 
 
 		 481 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  31.21 
 
 		 477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.04 
 
 		 541 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  27.95 
 
 		 483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  29.3 
 
 		 476 aa  212  9e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.68 
 
 		 481 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  30.69 
 
 		 485 aa  210  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  30.23 
 
 		 490 aa  209  7e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.41 
 
 		 479 aa  209  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  30.22 
 
 		 505 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  28.85 
 
 		 476 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  30.5 
 
 		 491 aa  207  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  30.59 
 
 		 479 aa  206  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.09 
 
 		 491 aa  206  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  31.25 
 
 		 479 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.08 
 
 		 472 aa  204  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  30.54 
 
 		 470 aa  202  9e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  30.34 
 
 		 499 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  30.96 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>