More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3504 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
484 aa  983    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  61.75 
 
 
481 aa  600  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.26 
 
 
486 aa  436  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  50.11 
 
 
486 aa  419  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.93 
 
 
486 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2057  cardiolipin synthetase 2  46.09 
 
 
486 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.830575  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1900  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.36 
 
 
486 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  36.4 
 
 
509 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  39.01 
 
 
502 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  36.2 
 
 
509 aa  320  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  36.27 
 
 
509 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  36.27 
 
 
509 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  36.07 
 
 
509 aa  319  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  36.07 
 
 
509 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  36.07 
 
 
509 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.1 
 
 
541 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  36.36 
 
 
509 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  37.71 
 
 
514 aa  312  9e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  35.22 
 
 
509 aa  312  9e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  37.5 
 
 
514 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  35.33 
 
 
509 aa  312  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  37.5 
 
 
514 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  37.5 
 
 
514 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  37.5 
 
 
514 aa  311  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  37.5 
 
 
514 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  37.5 
 
 
514 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  38.29 
 
 
502 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  37.29 
 
 
514 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  37.58 
 
 
514 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  37.58 
 
 
514 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.25 
 
 
485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  37.37 
 
 
514 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  34.56 
 
 
483 aa  300  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.33 
 
 
492 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.79 
 
 
477 aa  284  3.0000000000000004e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  34.62 
 
 
490 aa  282  9e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.88 
 
 
482 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  36.5 
 
 
479 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  34.51 
 
 
470 aa  277  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  35.28 
 
 
485 aa  276  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.05 
 
 
478 aa  273  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  34.98 
 
 
477 aa  268  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.58 
 
 
483 aa  264  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  36.04 
 
 
474 aa  264  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.85 
 
 
490 aa  264  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  34.91 
 
 
499 aa  262  8e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.02 
 
 
472 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  32.4 
 
 
476 aa  260  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  34.04 
 
 
473 aa  259  8e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  32.4 
 
 
476 aa  259  9e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  33.12 
 
 
481 aa  256  6e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  32.52 
 
 
486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  31.85 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  35.4 
 
 
479 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  34.4 
 
 
490 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  33.55 
 
 
478 aa  252  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1793  phospholipase D/transphosphatidylase  32.75 
 
 
497 aa  251  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  31.36 
 
 
487 aa  251  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2033  cardiolipin synthetase  32.26 
 
 
484 aa  251  2e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0028874  hitchhiker  0.0000142083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  34.5 
 
 
481 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  35.68 
 
 
505 aa  251  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  35.06 
 
 
479 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  35.27 
 
 
479 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  34.84 
 
 
479 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.1 
 
 
508 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.77 
 
 
486 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  33.47 
 
 
479 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  31.58 
 
 
480 aa  246  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  34.24 
 
 
477 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  34.24 
 
 
477 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  33.06 
 
 
482 aa  242  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.9 
 
 
526 aa  241  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  35.69 
 
 
491 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  30.91 
 
 
483 aa  239  9e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  31.03 
 
 
490 aa  238  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  32.31 
 
 
488 aa  238  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  33.4 
 
 
483 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  35.08 
 
 
490 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  29.74 
 
 
505 aa  237  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  29.74 
 
 
505 aa  237  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  31 
 
 
483 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  36.09 
 
 
481 aa  237  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  30.75 
 
 
494 aa  236  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  30.75 
 
 
494 aa  236  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  34.31 
 
 
478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.9 
 
 
498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  32.05 
 
 
478 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.11 
 
 
478 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  34.06 
 
 
479 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  32.16 
 
 
483 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  32.6 
 
 
477 aa  227  4e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.86 
 
 
484 aa  226  5.0000000000000005e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  33.4 
 
 
479 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  33.4 
 
 
479 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  33.4 
 
 
479 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  33.4 
 
 
479 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  33.4 
 
 
479 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  33.4 
 
 
479 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  33.4 
 
 
479 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  33.41 
 
 
478 aa  226  8e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>