More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4302 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 491 aa  1000    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  53.21 
 
 		 491 aa  511  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  51.69 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08050  cardiolipin synthetase 2  52.01 
 
 		 495 aa  479  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  51.36 
 
 		 467 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  38.16 
 
 		 467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  37.95 
 
 		 467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  37.7 
 
 		 478 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  37.33 
 
 		 489 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.63 
 
 		 481 aa  296  6e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.79 
 
 		 472 aa  293  6e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  36.25 
 
 		 472 aa  293  7e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  33.06 
 
 		 492 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  32.85 
 
 		 492 aa  252  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 		 486 aa  249  6e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  32.64 
 
 		 491 aa  249  7e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  33.87 
 
 		 532 aa  248  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  33.54 
 
 		 486 aa  246  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  31.8 
 
 		 486 aa  246  6.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  33.48 
 
 		 484 aa  246  8e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  32.44 
 
 		 486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.44 
 
 		 486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  32.44 
 
 		 486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 		 486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  32.44 
 
 		 486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  32.44 
 
 		 486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  32.44 
 
 		 486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  34.16 
 
 		 486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  32.44 
 
 		 486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  32.23 
 
 		 486 aa  243  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  33.13 
 
 		 486 aa  242  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  31.97 
 
 		 486 aa  242  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  33.13 
 
 		 486 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  32.42 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  33.13 
 
 		 486 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  32.83 
 
 		 486 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  32.83 
 
 		 486 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  32.83 
 
 		 486 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  32.83 
 
 		 486 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  32.83 
 
 		 486 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  31.4 
 
 		 483 aa  239  8e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  31.76 
 
 		 484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  31.82 
 
 		 486 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  31.73 
 
 		 484 aa  234  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  29.19 
 
 		 483 aa  234  4.0000000000000004e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  30.72 
 
 		 490 aa  233  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  33.7 
 
 		 484 aa  232  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  32.02 
 
 		 474 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  32.04 
 
 		 484 aa  230  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  34.17 
 
 		 471 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  34.25 
 
 		 475 aa  227  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  31.75 
 
 		 479 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  32.59 
 
 		 479 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.13 
 
 		 483 aa  225  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  31.86 
 
 		 479 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  31.08 
 
 		 479 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  30.59 
 
 		 485 aa  224  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  36.28 
 
 		 481 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  31.32 
 
 		 479 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  32.11 
 
 		 479 aa  223  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  31.18 
 
 		 479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  31.06 
 
 		 479 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  31.34 
 
 		 481 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  31.51 
 
 		 479 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  30.86 
 
 		 479 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.74 
 
 		 478 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  32.09 
 
 		 485 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  31.51 
 
 		 479 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  28 
 
 		 555 aa  217  4e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  31.51 
 
 		 479 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  31.7 
 
 		 502 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  30.88 
 
 		 479 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1551  cardiolipin synthetase  26.86 
 
 		 547 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970599  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.43 
 
 		 485 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.95 
 
 		 541 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.86 
 
 		 482 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  33.96 
 
 		 483 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  31.16 
 
 		 479 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  32.33 
 
 		 486 aa  213  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  30.95 
 
 		 479 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  32.31 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  30.25 
 
 		 502 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  31.15 
 
 		 491 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  34.35 
 
 		 483 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  30.64 
 
 		 483 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  31.15 
 
 		 490 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  30.17 
 
 		 483 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  31.05 
 
 		 482 aa  208  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  33.03 
 
 		 478 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  30.53 
 
 		 490 aa  207  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  32.09 
 
 		 478 aa  206  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  30.43 
 
 		 473 aa  205  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  31.35 
 
 		 477 aa  205  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  28.87 
 
 		 490 aa  204  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  30.08 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  31.43 
 
 		 479 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  31.03 
 
 		 479 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  31.03 
 
 		 479 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  28.43 
 
 		 480 aa  203  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  31.03 
 
 		 479 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>