More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0906 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0906  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 
427 aa  868    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.811495  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  39.95 
 
 
420 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.2 
 
 
420 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.24 
 
 
425 aa  331  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  43.6 
 
 
419 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  40.15 
 
 
420 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2290  phospholipase D/transphosphatidylase  43.43 
 
 
427 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  hitchhiker  0.000316655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  38.66 
 
 
446 aa  289  7e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  39.61 
 
 
436 aa  269  7e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  38.77 
 
 
502 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.5 
 
 
464 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.5 
 
 
464 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  36.46 
 
 
480 aa  229  5e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  32.54 
 
 
462 aa  229  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.94 
 
 
474 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.9 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.42 
 
 
374 aa  220  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  36.63 
 
 
474 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  35.26 
 
 
477 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  36.12 
 
 
482 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.42 
 
 
474 aa  216  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  35.53 
 
 
475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.2 
 
 
478 aa  210  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  34.16 
 
 
396 aa  209  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  29.11 
 
 
483 aa  209  9e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  35.04 
 
 
500 aa  209  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.42 
 
 
489 aa  209  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  35.22 
 
 
478 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.95 
 
 
478 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.75 
 
 
472 aa  208  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.97 
 
 
483 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  34.95 
 
 
478 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  36.26 
 
 
482 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  35.17 
 
 
484 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  34.59 
 
 
479 aa  203  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  34.22 
 
 
478 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  34.21 
 
 
476 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  34.06 
 
 
480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  34.47 
 
 
476 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.21 
 
 
476 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  37.36 
 
 
537 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  34.91 
 
 
479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  36.87 
 
 
481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  35.34 
 
 
478 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  29.2 
 
 
485 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.27 
 
 
478 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  31.91 
 
 
509 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  33.61 
 
 
474 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  34.55 
 
 
481 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  34.82 
 
 
479 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  35.03 
 
 
486 aa  195  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  33.95 
 
 
476 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.93 
 
 
541 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  31.65 
 
 
509 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  31.65 
 
 
509 aa  194  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  31.65 
 
 
509 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  31.91 
 
 
509 aa  193  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  34.12 
 
 
479 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  31.38 
 
 
509 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  31.38 
 
 
509 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  32.97 
 
 
481 aa  192  8e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  30.73 
 
 
458 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  30.71 
 
 
490 aa  192  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  32.8 
 
 
479 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  31 
 
 
445 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  32.63 
 
 
479 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  31.2 
 
 
502 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  34.38 
 
 
479 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.48 
 
 
487 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  31.75 
 
 
502 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  31.75 
 
 
509 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  34.22 
 
 
467 aa  190  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  32.43 
 
 
486 aa  190  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  34.13 
 
 
484 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  32.25 
 
 
486 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  31.38 
 
 
509 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.55 
 
 
472 aa  189  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  31.12 
 
 
509 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.24 
 
 
482 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.76 
 
 
486 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  31.72 
 
 
481 aa  188  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  32.51 
 
 
514 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.67 
 
 
485 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  32.24 
 
 
514 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4046  phospholipase D/transphosphatidylase  37.53 
 
 
406 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  32.24 
 
 
514 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  32.24 
 
 
514 aa  187  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  32.24 
 
 
514 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  32.24 
 
 
514 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  32.24 
 
 
514 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.96 
 
 
395 aa  186  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  30.62 
 
 
441 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  34.78 
 
 
481 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  30.53 
 
 
486 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  32.17 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  32.26 
 
 
487 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.98 
 
 
481 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  33.87 
 
 
472 aa  184  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.23 
 
 
487 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  30.62 
 
 
484 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>