More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1051 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 419 aa  860    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  59.41 
 
 		 420 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  58.57 
 
 		 420 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  60.35 
 
 		 420 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  62.12 
 
 		 425 aa  501  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2290  phospholipase D/transphosphatidylase  62.34 
 
 		 427 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  hitchhiker  0.000316655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  46.28 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0906  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.6 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.811495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  39.84 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  35.75 
 
 		 462 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  37.91 
 
 		 480 aa  242  7.999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  33.78 
 
 		 458 aa  236  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  34.96 
 
 		 509 aa  233  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  35.23 
 
 		 509 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  34.96 
 
 		 509 aa  232  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  34.96 
 
 		 509 aa  232  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  34.69 
 
 		 509 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.51 
 
 		 445 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  34.96 
 
 		 509 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  34.96 
 
 		 509 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.86 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  34.42 
 
 		 509 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  34.15 
 
 		 509 aa  229  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  34.15 
 
 		 509 aa  229  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  33.07 
 
 		 502 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.25 
 
 		 478 aa  223  7e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.69 
 
 		 478 aa  222  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  38.67 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  33.95 
 
 		 502 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  33.52 
 
 		 514 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.9 
 
 		 478 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  33.24 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  33.24 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  33.24 
 
 		 514 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.96 
 
 		 474 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  33.24 
 
 		 514 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  33.24 
 
 		 514 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  33.24 
 
 		 514 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  33.24 
 
 		 514 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  32.96 
 
 		 514 aa  216  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  33.24 
 
 		 514 aa  216  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  37.82 
 
 		 486 aa  216  8e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  36.62 
 
 		 478 aa  215  9e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.21 
 
 		 477 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3721  phospholipase D/transphosphatidylase  38.06 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  34.76 
 
 		 477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.91 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  32.69 
 
 		 483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  34.56 
 
 		 480 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  38.2 
 
 		 502 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05796  phospholipase D active site domain protein  51.15 
 
 		 404 aa  213  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  32.86 
 
 		 514 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  32.68 
 
 		 396 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.05 
 
 		 492 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  34.64 
 
 		 475 aa  210  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4046  phospholipase D/transphosphatidylase  37.94 
 
 		 406 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3316  phospholipase D/transphosphatidylase  37.24 
 
 		 451 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.68 
 
 		 474 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.98 
 
 		 483 aa  208  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  32.72 
 
 		 478 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  37.2 
 
 		 478 aa  206  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.56 
 
 		 374 aa  206  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 		 479 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  33.42 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  33.42 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  33.42 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  33.42 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  34.21 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  33.42 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  33.42 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  33.42 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  33.25 
 
 		 474 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.36 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.36 
 
 		 464 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  33.07 
 
 		 481 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  31.83 
 
 		 476 aa  202  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  32.28 
 
 		 476 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  34.94 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.83 
 
 		 476 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  36.13 
 
 		 481 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  34.91 
 
 		 482 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  33.51 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3346  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.58 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.47 
 
 		 490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  33.07 
 
 		 479 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.15 
 
 		 541 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  36.01 
 
 		 537 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.98 
 
 		 472 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.52 
 
 		 486 aa  199  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  35.69 
 
 		 484 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  32.53 
 
 		 477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  32.53 
 
 		 477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  33.78 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  32.8 
 
 		 479 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  32.53 
 
 		 479 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.06 
 
 		 420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  32.19 
 
 		 505 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.2 
 
 		 478 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2012  cardiolipin synthetase  33.69 
 
 		 479 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>