More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2243 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  100 
 
 		 480 aa  980    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  58.24 
 
 		 462 aa  537  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  58.04 
 
 		 475 aa  481  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  47.01 
 
 		 458 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.56 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  38.03 
 
 		 483 aa  270  5e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  40 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  39.58 
 
 		 396 aa  249  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  37.04 
 
 		 502 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.83 
 
 		 420 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.97 
 
 		 485 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  37.63 
 
 		 396 aa  240  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  36.29 
 
 		 420 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  35.28 
 
 		 502 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  35.29 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0906  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.22 
 
 		 427 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.811495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.27 
 
 		 482 aa  233  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  37.91 
 
 		 419 aa  232  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.39 
 
 		 392 aa  232  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.75 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.92 
 
 		 425 aa  229  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.38 
 
 		 420 aa  227  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  35.26 
 
 		 514 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  35.71 
 
 		 420 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  34.99 
 
 		 514 aa  226  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  34.99 
 
 		 514 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  34.99 
 
 		 514 aa  226  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  34.99 
 
 		 514 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  34.99 
 
 		 514 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  34.71 
 
 		 514 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  35.26 
 
 		 514 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  34.71 
 
 		 514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  34.32 
 
 		 446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0887  phospholipase D/transphosphatidylase  37.53 
 
 		 426 aa  219  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.37 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  34.16 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  34.82 
 
 		 477 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  34.24 
 
 		 499 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  35.05 
 
 		 436 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.04 
 
 		 541 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  34.07 
 
 		 514 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  35.12 
 
 		 485 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  35.11 
 
 		 502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.68 
 
 		 483 aa  215  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3607  phospholipase D/transphosphatidylase  37.2 
 
 		 401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000824683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.16 
 
 		 464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  36.89 
 
 		 484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.77 
 
 		 478 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2290  phospholipase D/transphosphatidylase  38.36 
 
 		 427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  hitchhiker  0.000316655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.48 
 
 		 476 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.39 
 
 		 464 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.32 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  36.48 
 
 		 476 aa  212  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  30.36 
 
 		 470 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  35.51 
 
 		 492 aa  212  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  35.44 
 
 		 480 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.53 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  34.91 
 
 		 478 aa  210  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  35.46 
 
 		 490 aa  210  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  36.84 
 
 		 476 aa  210  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  34.31 
 
 		 479 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.53 
 
 		 395 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  36.58 
 
 		 476 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0557  cardiolipin synthetase  37.43 
 
 		 514 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.14 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  36.92 
 
 		 537 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.77 
 
 		 490 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.25 
 
 		 472 aa  206  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  31.51 
 
 		 480 aa  206  8e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  35.71 
 
 		 479 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  34.5 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  36.44 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  35.2 
 
 		 479 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  35.2 
 
 		 479 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  35.2 
 
 		 479 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  34.14 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  35.2 
 
 		 479 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  35.09 
 
 		 479 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  35.2 
 
 		 479 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.61 
 
 		 486 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  35.2 
 
 		 479 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  34.48 
 
 		 479 aa  203  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  35.42 
 
 		 479 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  35.17 
 
 		 483 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.96 
 
 		 478 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  34.57 
 
 		 479 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.04 
 
 		 481 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  33.69 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.13 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  35.16 
 
 		 481 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  34.11 
 
 		 483 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  33.78 
 
 		 479 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  35.16 
 
 		 479 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  32.21 
 
 		 473 aa  200  6e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.79 
 
 		 484 aa  199  9e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.3 
 
 		 483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.46 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0415723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  31.27 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  31.27 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  31.27 
 
 		 509 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>