More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0887 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0887  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 426 aa  853    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2817  phospholipase D/transphosphatidylase  52.39 
 
 		 412 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230147  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  52.31 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0415723  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18330  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  50.77 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4096  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.86 
 
 		 413 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2838  phospholipase D/transphosphatidylase  48.1 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1297  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.63 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641599  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  48.14 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  50.27 
 
 		 410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  40.95 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21690  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  41.67 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  38.32 
 
 		 462 aa  216  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  36.61 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.61 
 
 		 445 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  32.15 
 
 		 476 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  37.53 
 
 		 480 aa  203  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  35.2 
 
 		 499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  31.79 
 
 		 476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  37.33 
 
 		 477 aa  199  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  36.31 
 
 		 475 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  33.51 
 
 		 483 aa  196  5.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.87 
 
 		 482 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  33.89 
 
 		 505 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  33.89 
 
 		 505 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.97 
 
 		 508 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.99 
 
 		 472 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  31.1 
 
 		 494 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  31.1 
 
 		 494 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  32.35 
 
 		 485 aa  186  9e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  31.59 
 
 		 488 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.69 
 
 		 483 aa  185  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  31.28 
 
 		 490 aa  184  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.41 
 
 		 374 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  34.19 
 
 		 482 aa  183  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.17 
 
 		 420 aa  183  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  30.48 
 
 		 441 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  31.95 
 
 		 480 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  33.71 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.88 
 
 		 474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  33.9 
 
 		 479 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.93 
 
 		 485 aa  179  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.77 
 
 		 526 aa  178  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.17 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  30.5 
 
 		 470 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  34.06 
 
 		 477 aa  176  8e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  35.22 
 
 		 474 aa  176  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  32.6 
 
 		 502 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  33.98 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  34.26 
 
 		 477 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  32.94 
 
 		 479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  31.05 
 
 		 483 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3455  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.87 
 
 		 396 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  32.7 
 
 		 479 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0679  phospholipase D/transphosphatidylase  37.93 
 
 		 466 aa  172  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  31.71 
 
 		 479 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  31.44 
 
 		 481 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.28 
 
 		 541 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4507  phospholipase D/transphosphatidylase  33.9 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.17 
 
 		 478 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  32.07 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  32.77 
 
 		 478 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  32.07 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  30.89 
 
 		 502 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  30.42 
 
 		 490 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  32.15 
 
 		 479 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  34.38 
 
 		 481 aa  170  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.87 
 
 		 490 aa  170  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.92 
 
 		 478 aa  170  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  29.63 
 
 		 483 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  34.06 
 
 		 489 aa  169  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  30.68 
 
 		 483 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  31.78 
 
 		 505 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  29.63 
 
 		 483 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  31.18 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  31.61 
 
 		 396 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4057  cardiolipin synthetase  31.55 
 
 		 518 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.98 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0222  putative cardiolipin synthetase  30.86 
 
 		 497 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.04 
 
 		 498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  31.73 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.53 
 
 		 420 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.42 
 
 		 478 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  30.11 
 
 		 480 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  30.59 
 
 		 476 aa  166  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.22 
 
 		 476 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  30.08 
 
 		 509 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  30.08 
 
 		 509 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  30.35 
 
 		 509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  28.76 
 
 		 487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  31.28 
 
 		 476 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  30.56 
 
 		 479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  30.08 
 
 		 509 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  29.81 
 
 		 509 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  30.81 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  30.08 
 
 		 509 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  30.4 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  30.28 
 
 		 500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  29.81 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  33.42 
 
 		 419 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  28.49 
 
 		 485 aa  164  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>