More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0482 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  100 
 
 
396 aa  802    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  83.84 
 
 
396 aa  665    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  65.15 
 
 
396 aa  536  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  59.09 
 
 
395 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  58.84 
 
 
395 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.22 
 
 
392 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3607  phospholipase D/transphosphatidylase  49.86 
 
 
401 aa  341  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000824683  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  38.21 
 
 
462 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  39.5 
 
 
458 aa  249  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  39.58 
 
 
480 aa  249  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  40.49 
 
 
475 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.67 
 
 
445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0557  cardiolipin synthetase  36.89 
 
 
514 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  32.88 
 
 
509 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  33.15 
 
 
509 aa  223  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.03 
 
 
482 aa  222  9e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  32.6 
 
 
509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  32.07 
 
 
509 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  32.07 
 
 
509 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  32.33 
 
 
509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  32.88 
 
 
509 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  32.05 
 
 
509 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  32.05 
 
 
509 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.41 
 
 
485 aa  219  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  32.33 
 
 
509 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  32.56 
 
 
514 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  32.83 
 
 
502 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  32.21 
 
 
485 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  33.52 
 
 
514 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  32.37 
 
 
483 aa  217  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  32.97 
 
 
514 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  32.97 
 
 
514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  32.97 
 
 
514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  33.24 
 
 
514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  32.97 
 
 
514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  32.97 
 
 
514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  32.97 
 
 
514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.33 
 
 
420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  35.98 
 
 
410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  33.16 
 
 
502 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.37 
 
 
472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  32.69 
 
 
514 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  34.6 
 
 
478 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  33.61 
 
 
514 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  37.71 
 
 
477 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  37.71 
 
 
477 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  34.96 
 
 
499 aa  209  7e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.97 
 
 
425 aa  209  9e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  31.9 
 
 
470 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  34.93 
 
 
479 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.14 
 
 
526 aa  206  4e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.53 
 
 
484 aa  206  4e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  35.46 
 
 
479 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.88 
 
 
478 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  34.9 
 
 
441 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  35.84 
 
 
477 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  35.59 
 
 
476 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.54 
 
 
476 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  36.24 
 
 
483 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  35.99 
 
 
478 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  35 
 
 
476 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  35.48 
 
 
477 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  33.58 
 
 
436 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  35.21 
 
 
476 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0222  putative cardiolipin synthetase  29.95 
 
 
497 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.53 
 
 
492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  37.29 
 
 
480 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.49 
 
 
478 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  32.53 
 
 
420 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  35.31 
 
 
474 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  36.6 
 
 
478 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  33.78 
 
 
419 aa  200  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  36.26 
 
 
483 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  35.44 
 
 
446 aa  199  7e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  36 
 
 
474 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  33 
 
 
396 aa  199  9e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  36.23 
 
 
479 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  36.23 
 
 
479 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1712  phospholipase D/transphosphatidylase  33.79 
 
 
545 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  36.23 
 
 
479 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  31.83 
 
 
420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  36.23 
 
 
479 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  36.23 
 
 
479 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  36.23 
 
 
479 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  36.23 
 
 
479 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  37.71 
 
 
489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1297  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.32 
 
 
453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641599  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  32.66 
 
 
484 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.85 
 
 
483 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  35.01 
 
 
479 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  33.88 
 
 
484 aa  196  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2817  phospholipase D/transphosphatidylase  34.88 
 
 
412 aa  196  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  35.71 
 
 
479 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  32.16 
 
 
474 aa  196  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.96 
 
 
374 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3455  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.97 
 
 
396 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0679  phospholipase D/transphosphatidylase  34.36 
 
 
466 aa  196  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  31.94 
 
 
481 aa  196  9e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  34.37 
 
 
481 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.14 
 
 
541 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>