More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0679 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0679  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
466 aa  911    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0557  cardiolipin synthetase  44.32 
 
 
514 aa  342  7e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  51.37 
 
 
537 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1712  phospholipase D/transphosphatidylase  40.84 
 
 
545 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  36.05 
 
 
462 aa  213  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  34.66 
 
 
396 aa  207  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  35.18 
 
 
458 aa  204  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.18 
 
 
445 aa  201  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  39.55 
 
 
481 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  32.29 
 
 
483 aa  192  7e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  37.43 
 
 
480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  36.13 
 
 
483 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  35.83 
 
 
479 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  35.83 
 
 
479 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  35.83 
 
 
479 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  35.83 
 
 
479 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  35.83 
 
 
479 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  35.79 
 
 
483 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  35.83 
 
 
479 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  35.83 
 
 
479 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.01 
 
 
485 aa  186  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  34.36 
 
 
396 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  36.52 
 
 
481 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  36.24 
 
 
479 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  35.98 
 
 
479 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  35.67 
 
 
479 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  29.69 
 
 
514 aa  180  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  34.08 
 
 
479 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  34.15 
 
 
396 aa  179  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  33.7 
 
 
479 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  33.71 
 
 
479 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  33.7 
 
 
479 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  35.67 
 
 
479 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2012  cardiolipin synthetase  36.67 
 
 
479 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.07 
 
 
490 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3721  phospholipase D/transphosphatidylase  36.69 
 
 
439 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  30.26 
 
 
514 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  32.7 
 
 
475 aa  176  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  33.71 
 
 
479 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  30 
 
 
514 aa  176  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  30 
 
 
514 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  30 
 
 
514 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  30 
 
 
514 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  30 
 
 
514 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  30 
 
 
514 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  30 
 
 
514 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0887  phospholipase D/transphosphatidylase  37.64 
 
 
426 aa  176  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  37.61 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.54 
 
 
482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  34.37 
 
 
479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  29.74 
 
 
514 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  33.07 
 
 
477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  34.08 
 
 
479 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  33.16 
 
 
474 aa  173  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  34.18 
 
 
477 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  34.18 
 
 
477 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  33.71 
 
 
479 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  33.99 
 
 
478 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  31.45 
 
 
420 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  33.71 
 
 
479 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  29.74 
 
 
514 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  34.19 
 
 
490 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  30.39 
 
 
502 aa  169  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  29.81 
 
 
509 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  38.04 
 
 
382 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  35.17 
 
 
477 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  35.59 
 
 
481 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  31.2 
 
 
480 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3435  phospholipase D/transphosphatidylase  35.23 
 
 
420 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358165  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  29.89 
 
 
502 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  31.48 
 
 
473 aa  167  4e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  31.2 
 
 
485 aa  167  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4096  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.42 
 
 
413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  30.31 
 
 
441 aa  166  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.38 
 
 
392 aa  166  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  28.57 
 
 
490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  29.4 
 
 
509 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  29.4 
 
 
509 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.03 
 
 
486 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  29.67 
 
 
509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  29.4 
 
 
509 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  30 
 
 
509 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  29.4 
 
 
509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  29.73 
 
 
509 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  29.4 
 
 
509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  29.4 
 
 
509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  33.71 
 
 
490 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.96 
 
 
478 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  37.13 
 
 
385 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4046  phospholipase D/transphosphatidylase  35.11 
 
 
406 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  32.69 
 
 
505 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  33.43 
 
 
491 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.94 
 
 
420 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4057  cardiolipin synthetase  33.99 
 
 
518 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.84 
 
 
420 aa  163  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  31.37 
 
 
420 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  30.17 
 
 
487 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.83 
 
 
478 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.77 
 
 
395 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.78 
 
 
487 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>