More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1132 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 382 aa  762    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  68.93 
 
 		 385 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  67.89 
 
 		 385 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  67.97 
 
 		 385 aa  522  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4044  phospholipase D/transphosphatidylase  68.93 
 
 		 385 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.185859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  67.1 
 
 		 385 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  67.1 
 
 		 385 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4349  phospholipase D family protein  67.62 
 
 		 385 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  67.27 
 
 		 385 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  66.14 
 
 		 386 aa  485  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  68.25 
 
 		 359 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0862  phospholipase D/transphosphatidylase  48.19 
 
 		 370 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.94 
 
 		 392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0271  putative synthetase  47.97 
 
 		 392 aa  299  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  34.06 
 
 		 420 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  34.06 
 
 		 420 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.43 
 
 		 420 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  34.9 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  37.96 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  33.87 
 
 		 474 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  36.57 
 
 		 481 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  36.29 
 
 		 479 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  36 
 
 		 479 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  34.29 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  35.71 
 
 		 479 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.81 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.41 
 
 		 490 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  33.81 
 
 		 479 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  32.95 
 
 		 479 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  35.79 
 
 		 416 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  33.9 
 
 		 478 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  36.31 
 
 		 413 aa  187  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  37.57 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.5 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  33.42 
 
 		 483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  33.89 
 
 		 478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  33.97 
 
 		 416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4507  phospholipase D/transphosphatidylase  35.45 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  38.41 
 
 		 405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4046  phospholipase D/transphosphatidylase  36.49 
 
 		 406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  35 
 
 		 479 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  35.12 
 
 		 413 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  35.12 
 
 		 413 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  35.12 
 
 		 413 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  35.12 
 
 		 413 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  35.12 
 
 		 413 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  33.76 
 
 		 451 aa  182  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  37.84 
 
 		 401 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  36.64 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  31.25 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  32.6 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  38.11 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  32.64 
 
 		 462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 		 419 aa  180  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  36.52 
 
 		 481 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  34.34 
 
 		 483 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  35 
 
 		 478 aa  179  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  35.87 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  35.33 
 
 		 491 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  36.21 
 
 		 481 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  33.7 
 
 		 479 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  32.67 
 
 		 484 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  33.98 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.51 
 
 		 445 aa  177  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0679  phospholipase D/transphosphatidylase  38.31 
 
 		 466 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  34.78 
 
 		 490 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  33.89 
 
 		 479 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  37.5 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  35.73 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  34.15 
 
 		 416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  30.43 
 
 		 485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  32.8 
 
 		 490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  35.57 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  35.98 
 
 		 400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  33.96 
 
 		 505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  34.82 
 
 		 400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  33.42 
 
 		 479 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  33.42 
 
 		 479 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  33.42 
 
 		 479 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  33.42 
 
 		 479 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  33.42 
 
 		 479 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  33.42 
 
 		 479 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.65 
 
 		 374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  33.42 
 
 		 479 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  38.36 
 
 		 442 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  32.68 
 
 		 477 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  30.39 
 
 		 514 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.29 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0906  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.7 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.811495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  32.78 
 
 		 446 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  34.93 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  34.93 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  34.93 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  35.08 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  33.98 
 
 		 479 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  34.63 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  30.66 
 
 		 514 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0278  phospholipase D family protein  36.3 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  34.63 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  33.79 
 
 		 477 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>