More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0012 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  100 
 
 		 422 aa  855    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  65.5 
 
 		 413 aa  528  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  65.12 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  61.25 
 
 		 403 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  60.75 
 
 		 405 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  65.35 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  67.26 
 
 		 416 aa  482  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  60.77 
 
 		 416 aa  481  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  56.16 
 
 		 460 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  53.04 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  53.04 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  53.04 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  53.04 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  52.8 
 
 		 413 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  52.53 
 
 		 413 aa  435  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  53.41 
 
 		 413 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  53.17 
 
 		 413 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  53.41 
 
 		 413 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  53.17 
 
 		 413 aa  432  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  53.17 
 
 		 413 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  53.17 
 
 		 413 aa  432  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  53.17 
 
 		 413 aa  432  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  52.93 
 
 		 413 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  52.93 
 
 		 413 aa  428  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  56.49 
 
 		 400 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  54.87 
 
 		 428 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  54.73 
 
 		 400 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  54.26 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  55.33 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  54.26 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  53.42 
 
 		 401 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  53.45 
 
 		 401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  53.75 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  51.47 
 
 		 401 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  50.98 
 
 		 401 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  46.76 
 
 		 416 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  52.02 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  47.24 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  42.65 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  39.28 
 
 		 451 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  39.39 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  39.67 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  42.82 
 
 		 461 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  41.48 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.32 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  41.24 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  38.33 
 
 		 426 aa  203  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  39.05 
 
 		 410 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  39.03 
 
 		 422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  38.3 
 
 		 424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  38.3 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  38.3 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  38.6 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  38.6 
 
 		 424 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.04 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  38.6 
 
 		 424 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.5 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  38.3 
 
 		 424 aa  190  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  39.71 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  38.12 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.71 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  38.11 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  39.94 
 
 		 410 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  39.94 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  39.94 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  39.94 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.29 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  39.94 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  39.94 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  39.94 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  35.59 
 
 		 396 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  38.78 
 
 		 424 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  36.05 
 
 		 396 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  34.45 
 
 		 396 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  36.02 
 
 		 414 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  38.44 
 
 		 439 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  34.97 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  34.49 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.77 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  35.98 
 
 		 478 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.61 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  34.63 
 
 		 483 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.91 
 
 		 474 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.55 
 
 		 474 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0271  putative synthetase  35.4 
 
 		 392 aa  166  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.55 
 
 		 374 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  36.67 
 
 		 385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  35.03 
 
 		 514 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.44 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  30.89 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  37.5 
 
 		 382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  36.64 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  34.71 
 
 		 514 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  34.71 
 
 		 514 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  34.71 
 
 		 514 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.64 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  34.71 
 
 		 514 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  34.91 
 
 		 483 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  34.71 
 
 		 514 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  34.59 
 
 		 514 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>