More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0868 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 414 aa  836    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  76.74 
 
 		 439 aa  599  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  63.57 
 
 		 410 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  56.46 
 
 		 411 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  58.11 
 
 		 409 aa  431  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  58.6 
 
 		 409 aa  434  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  59.47 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  48.19 
 
 		 461 aa  316  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  47.09 
 
 		 442 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  46.96 
 
 		 422 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.96 
 
 		 422 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.96 
 
 		 422 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  41.23 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  44.39 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  44.63 
 
 		 424 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  44.39 
 
 		 424 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  44.39 
 
 		 424 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  44.15 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  44.14 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  42.93 
 
 		 424 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  42.68 
 
 		 424 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  42.93 
 
 		 426 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.36 
 
 		 419 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  45.04 
 
 		 424 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  44.33 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  44.33 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  44.33 
 
 		 424 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  44.33 
 
 		 424 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  43.35 
 
 		 419 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  44.31 
 
 		 424 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  44.33 
 
 		 424 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  44.31 
 
 		 410 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  41.44 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.44 
 
 		 384 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  40.05 
 
 		 397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  35.84 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  35.84 
 
 		 413 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  35.84 
 
 		 413 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  35.84 
 
 		 413 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  35.84 
 
 		 413 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  35.93 
 
 		 413 aa  216  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  44.2 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  39.1 
 
 		 405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  39.04 
 
 		 403 aa  213  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  35.14 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  34.89 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  34.89 
 
 		 413 aa  210  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  34.89 
 
 		 413 aa  210  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  34.64 
 
 		 413 aa  209  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  35.86 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  34.64 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  34.64 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  34.4 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  34.64 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  38.38 
 
 		 413 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  39.12 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  38.64 
 
 		 401 aa  203  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  38.92 
 
 		 401 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  38.95 
 
 		 400 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  37.04 
 
 		 400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  41.8 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  38.27 
 
 		 400 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  37.34 
 
 		 433 aa  196  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  35.5 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  37.91 
 
 		 400 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  33.5 
 
 		 401 aa  192  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  35.89 
 
 		 436 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  37.03 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  35.94 
 
 		 401 aa  188  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  38.69 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  33.33 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  35.56 
 
 		 416 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  34.42 
 
 		 416 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  30.5 
 
 		 396 aa  163  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  32.51 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  29.44 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  30.51 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  32.76 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  31.62 
 
 		 385 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  30.39 
 
 		 487 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  30.41 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.03 
 
 		 487 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  30 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  31.08 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  30.81 
 
 		 385 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.54 
 
 		 487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.15 
 
 		 392 aa  141  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.12 
 
 		 374 aa  139  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  29.64 
 
 		 475 aa  139  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.54 
 
 		 485 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  28.46 
 
 		 485 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.12 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  30.15 
 
 		 486 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.64 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  32.9 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  29.9 
 
 		 486 aa  136  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  30.5 
 
 		 480 aa  136  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  30.64 
 
 		 385 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  29.95 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  32.17 
 
 		 382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>