More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1328 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
410 aa  810    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  71.15 
 
 
409 aa  526  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  71.64 
 
 
409 aa  526  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  71.74 
 
 
422 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  60.05 
 
 
411 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  63.59 
 
 
439 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  63.81 
 
 
414 aa  448  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  51.13 
 
 
461 aa  308  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  49.87 
 
 
442 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  42.82 
 
 
383 aa  295  8e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  45.06 
 
 
396 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  46.4 
 
 
422 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.06 
 
 
422 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.25 
 
 
422 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  45.16 
 
 
451 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  43.9 
 
 
426 aa  255  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  43.58 
 
 
424 aa  250  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.64 
 
 
419 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  44.17 
 
 
424 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  43.69 
 
 
424 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  42.08 
 
 
397 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  43.13 
 
 
424 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  43.36 
 
 
419 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  43.69 
 
 
424 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  43.69 
 
 
424 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  43.69 
 
 
424 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.64 
 
 
384 aa  239  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  43.9 
 
 
424 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  43.9 
 
 
410 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  43.9 
 
 
424 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  43.9 
 
 
424 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  42.75 
 
 
437 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  43.66 
 
 
424 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  43.9 
 
 
424 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  43.9 
 
 
424 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  43.31 
 
 
424 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  41.76 
 
 
405 aa  217  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  41.49 
 
 
403 aa  216  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  36.13 
 
 
413 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  34.24 
 
 
413 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  34.24 
 
 
413 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  39.41 
 
 
428 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  34.24 
 
 
413 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  34.24 
 
 
413 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  34.24 
 
 
413 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  39.05 
 
 
422 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  41.99 
 
 
417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  41.13 
 
 
401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  36.36 
 
 
413 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  40.85 
 
 
401 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  36.1 
 
 
413 aa  196  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  36.1 
 
 
413 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  36.1 
 
 
413 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  35.84 
 
 
413 aa  195  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  36.1 
 
 
413 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  39.15 
 
 
400 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  35.84 
 
 
413 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  36.1 
 
 
413 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  40.66 
 
 
413 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  39.32 
 
 
400 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  35.84 
 
 
413 aa  193  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  39.09 
 
 
400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  38.42 
 
 
400 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  38.31 
 
 
400 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  37.97 
 
 
416 aa  188  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  38.11 
 
 
433 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  38.56 
 
 
436 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  35.23 
 
 
460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  36.8 
 
 
401 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  35.55 
 
 
401 aa  182  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  35.19 
 
 
416 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  38.69 
 
 
416 aa  170  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  37.67 
 
 
363 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  32.23 
 
 
396 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  31.34 
 
 
462 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.85 
 
 
485 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  35.47 
 
 
416 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  32.01 
 
 
385 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  28.82 
 
 
481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.72 
 
 
474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.28 
 
 
374 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  31.55 
 
 
385 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  33.6 
 
 
482 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.32 
 
 
392 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.8 
 
 
478 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  27.55 
 
 
485 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  31.88 
 
 
419 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  32.13 
 
 
396 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  28.06 
 
 
485 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.94 
 
 
483 aa  144  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  28.05 
 
 
502 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  31.95 
 
 
480 aa  144  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.71 
 
 
492 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  32.9 
 
 
359 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.19 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  32.07 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.11 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  30.3 
 
 
479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  29.43 
 
 
485 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.4 
 
 
482 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>