More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_24820 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  100 
 
 
363 aa  738    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  57.42 
 
 
400 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  57.06 
 
 
400 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  58.33 
 
 
433 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  60.12 
 
 
428 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  58.29 
 
 
400 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  57.34 
 
 
400 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  55.11 
 
 
413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  55.11 
 
 
413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  55.11 
 
 
413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  55.11 
 
 
413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  54.83 
 
 
413 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  55.11 
 
 
413 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  55.59 
 
 
416 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  54.57 
 
 
413 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  54.29 
 
 
413 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  57.85 
 
 
400 aa  391  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  57.22 
 
 
401 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  54.57 
 
 
413 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  54.57 
 
 
413 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  54.29 
 
 
413 aa  391  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  56.61 
 
 
436 aa  391  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  54.57 
 
 
413 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  54.29 
 
 
413 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  54.29 
 
 
413 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  54.29 
 
 
413 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  57.26 
 
 
416 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  56.21 
 
 
405 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  55.65 
 
 
403 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  54.96 
 
 
401 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  52.02 
 
 
422 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  57.79 
 
 
401 aa  381  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  56.66 
 
 
401 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  49.01 
 
 
460 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  54.96 
 
 
413 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  51 
 
 
416 aa  358  8e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  52.68 
 
 
416 aa  356  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  52.2 
 
 
417 aa  338  7e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  41.61 
 
 
396 aa  206  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  40.57 
 
 
451 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  40.27 
 
 
383 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  38.23 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  40 
 
 
422 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  39.4 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  37.97 
 
 
409 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.68 
 
 
409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.46 
 
 
384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.75 
 
 
422 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  37.18 
 
 
422 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  37.46 
 
 
411 aa  170  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  39.48 
 
 
442 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  36.92 
 
 
461 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  37.88 
 
 
410 aa  166  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  41.01 
 
 
424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  38.44 
 
 
414 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  41.27 
 
 
424 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  39.16 
 
 
439 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  40.76 
 
 
424 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  38.22 
 
 
424 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  38.93 
 
 
426 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  38.22 
 
 
424 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  38.22 
 
 
424 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  39.43 
 
 
424 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  35.91 
 
 
422 aa  156  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  38.54 
 
 
424 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  38.78 
 
 
419 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  39.33 
 
 
424 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.44 
 
 
419 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  39.33 
 
 
424 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  39.33 
 
 
424 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  39.33 
 
 
424 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  39.33 
 
 
424 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  39.33 
 
 
410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  39.33 
 
 
424 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  36.86 
 
 
359 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  36.95 
 
 
385 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  35.29 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  33.22 
 
 
396 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4349  phospholipase D family protein  33.02 
 
 
385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.6 
 
 
445 aa  133  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  32.59 
 
 
396 aa  132  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  32.17 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  29.64 
 
 
458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4044  phospholipase D/transphosphatidylase  35.02 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.185859  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  35.74 
 
 
481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  33.56 
 
 
385 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  30.87 
 
 
489 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.8 
 
 
374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3455  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.45 
 
 
396 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.8 
 
 
474 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.25 
 
 
395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  31.91 
 
 
487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  34.72 
 
 
382 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.76 
 
 
483 aa  126  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  32.99 
 
 
385 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3264  cardiolipin synthetase domain protein  27.95 
 
 
377 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.415257  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2123  cardiolipin synthetase domain-containing protein  28.44 
 
 
394 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  30.48 
 
 
406 aa  125  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  31.73 
 
 
410 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.12 
 
 
395 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>