More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3008 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  100 
 
 		 403 aa  817    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  98.52 
 
 		 405 aa  801    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  68.09 
 
 		 460 aa  590  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  61.25 
 
 		 422 aa  505  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  61.1 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  61.14 
 
 		 436 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  61.4 
 
 		 416 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  60.24 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  63.59 
 
 		 416 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  58.46 
 
 		 400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  55.22 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  54.32 
 
 		 413 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  54.32 
 
 		 413 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  54.32 
 
 		 413 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  54.07 
 
 		 413 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  54.32 
 
 		 413 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  55.56 
 
 		 400 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  55.73 
 
 		 400 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  55.81 
 
 		 428 aa  418  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  53.69 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  52.9 
 
 		 413 aa  408  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  54.11 
 
 		 400 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  52.9 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  52.9 
 
 		 413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  52.9 
 
 		 413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  52.9 
 
 		 413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  52.9 
 
 		 413 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  52.9 
 
 		 413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  52.39 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  52.39 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  54.18 
 
 		 401 aa  398  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  53.48 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  53.02 
 
 		 401 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  52.69 
 
 		 401 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  51.05 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  55.65 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  52.7 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  52.52 
 
 		 416 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  40.89 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  40.59 
 
 		 461 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  39.69 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  40 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  39.73 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  39.35 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  37.97 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.28 
 
 		 422 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.47 
 
 		 384 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  41.49 
 
 		 410 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  40.56 
 
 		 422 aa  216  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  40.34 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.09 
 
 		 422 aa  213  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  39.55 
 
 		 424 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  39.55 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  39.55 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  39.89 
 
 		 424 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  39.26 
 
 		 424 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  39.89 
 
 		 424 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  38.85 
 
 		 439 aa  199  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  39.26 
 
 		 424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.03 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  40.46 
 
 		 419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  39.07 
 
 		 409 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  38.54 
 
 		 414 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.07 
 
 		 409 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  39.54 
 
 		 437 aa  196  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  37.2 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  38.35 
 
 		 479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  36.46 
 
 		 396 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  37.94 
 
 		 422 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  39.02 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.17 
 
 		 474 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  39.02 
 
 		 424 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  37.76 
 
 		 385 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  39.02 
 
 		 424 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  38.9 
 
 		 424 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  39.02 
 
 		 424 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  38.9 
 
 		 424 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  39.02 
 
 		 424 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  37.46 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  36.28 
 
 		 479 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  35.82 
 
 		 479 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  37.73 
 
 		 483 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.64 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.2 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  39.76 
 
 		 481 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  38.87 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.58 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  35.04 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  35.88 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  36.68 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.51 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.01 
 
 		 425 aa  170  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.63 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  38.11 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  37.73 
 
 		 490 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.14 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  37 
 
 		 483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  34.45 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.55 
 
 		 485 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  31.66 
 
 		 458 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>