More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3725 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  98.52 
 
 
403 aa  801    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  100 
 
 
405 aa  822    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  68.09 
 
 
460 aa  590  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  60.75 
 
 
422 aa  505  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  61.19 
 
 
413 aa  501  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  61.32 
 
 
436 aa  488  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  62.16 
 
 
416 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  61.78 
 
 
433 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  63.09 
 
 
416 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  58.16 
 
 
400 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  55.95 
 
 
413 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  55.95 
 
 
413 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  55.95 
 
 
413 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  55.95 
 
 
413 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  55.7 
 
 
413 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  55.14 
 
 
400 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  55.64 
 
 
400 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  55.47 
 
 
400 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  54.06 
 
 
413 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  55.3 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  53.4 
 
 
413 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  53.4 
 
 
413 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  53.4 
 
 
413 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  53.4 
 
 
413 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  53.4 
 
 
413 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  53.4 
 
 
413 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  53.4 
 
 
413 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  53.6 
 
 
400 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  52.9 
 
 
413 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  52.9 
 
 
413 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  54.18 
 
 
401 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  52.24 
 
 
401 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  53.47 
 
 
417 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  56.21 
 
 
363 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  52.69 
 
 
401 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  50.52 
 
 
416 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  52.31 
 
 
401 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  52.89 
 
 
416 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  40.73 
 
 
396 aa  256  7e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  40.26 
 
 
397 aa  243  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  40.73 
 
 
461 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  38.9 
 
 
383 aa  236  7e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  40 
 
 
411 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  39.29 
 
 
442 aa  226  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  37.97 
 
 
451 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  41.76 
 
 
410 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.03 
 
 
422 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  40.05 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  40.4 
 
 
426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.26 
 
 
384 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  40.4 
 
 
424 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  40.4 
 
 
424 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  40.4 
 
 
424 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  40.68 
 
 
424 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.84 
 
 
422 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  40.12 
 
 
424 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  39.5 
 
 
439 aa  203  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  40.17 
 
 
424 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  40.12 
 
 
424 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  40.05 
 
 
437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  37.78 
 
 
414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  39.07 
 
 
409 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.07 
 
 
409 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  40.17 
 
 
419 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.91 
 
 
419 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  37.05 
 
 
396 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  39.53 
 
 
410 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  39.53 
 
 
424 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  39.53 
 
 
424 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  39.53 
 
 
424 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  39.53 
 
 
424 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  39.53 
 
 
424 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  39.53 
 
 
424 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  37.56 
 
 
422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  36.66 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  38.35 
 
 
479 aa  182  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  37.98 
 
 
385 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  36.64 
 
 
424 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.58 
 
 
474 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  38.11 
 
 
483 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  39.46 
 
 
481 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  35.5 
 
 
396 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  36.75 
 
 
479 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  36.28 
 
 
479 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  37.85 
 
 
478 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  38.87 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.99 
 
 
374 aa  173  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  36.57 
 
 
385 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  38.41 
 
 
382 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.45 
 
 
395 aa  170  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.03 
 
 
395 aa  170  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.22 
 
 
420 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.93 
 
 
445 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.43 
 
 
425 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  35 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  31.5 
 
 
458 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  33.99 
 
 
419 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.49 
 
 
485 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  37.27 
 
 
490 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0557  cardiolipin synthetase  34.51 
 
 
514 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>