More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6327 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  100 
 
 		 413 aa  844    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  65.5 
 
 		 422 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  61.6 
 
 		 403 aa  508  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  61.69 
 
 		 405 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  56.88 
 
 		 460 aa  487  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  61.31 
 
 		 436 aa  484  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  62.41 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  59.36 
 
 		 416 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  61.58 
 
 		 416 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  50.88 
 
 		 413 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  50.88 
 
 		 413 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  50.75 
 
 		 413 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  50.88 
 
 		 413 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  50.88 
 
 		 413 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  50.63 
 
 		 413 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  55.16 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  50.25 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  50.25 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  50.25 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  50.25 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  50.25 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  50.25 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  50.25 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  50.25 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  50 
 
 		 413 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  51.63 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  50.88 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  49.88 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  50.88 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  50.88 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  49.38 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  50.63 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  53.02 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  54.96 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  49.62 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  49.62 
 
 		 401 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  45.89 
 
 		 416 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  45.93 
 
 		 416 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  39.73 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  42.17 
 
 		 383 aa  230  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  38.7 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  38.11 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  41.4 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  41.74 
 
 		 461 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  42.11 
 
 		 442 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  37.95 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.86 
 
 		 422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.35 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  39.75 
 
 		 437 aa  201  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  38.42 
 
 		 439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  35.08 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.24 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  39.83 
 
 		 410 aa  196  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  38.61 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  37.87 
 
 		 414 aa  193  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  38.74 
 
 		 419 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  37.5 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  38.33 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.48 
 
 		 419 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  37.22 
 
 		 424 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  37.22 
 
 		 424 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  38.06 
 
 		 424 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  37.78 
 
 		 424 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  38.21 
 
 		 409 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  38.61 
 
 		 422 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.33 
 
 		 420 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.94 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  37.57 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  38.92 
 
 		 424 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  38.92 
 
 		 410 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  38.92 
 
 		 424 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  38.92 
 
 		 424 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  38.92 
 
 		 424 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  38.92 
 
 		 424 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  38.92 
 
 		 424 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0862  phospholipase D/transphosphatidylase  35.86 
 
 		 370 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  38.18 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  38.33 
 
 		 424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  33.52 
 
 		 396 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.41 
 
 		 445 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  31.65 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  32.98 
 
 		 385 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  35.76 
 
 		 386 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  32.49 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.64 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.05 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  31.05 
 
 		 385 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.98 
 
 		 385 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  34.03 
 
 		 385 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.78 
 
 		 374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  34.2 
 
 		 385 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.78 
 
 		 474 aa  166  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  32.98 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.72 
 
 		 425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4349  phospholipase D family protein  33.96 
 
 		 385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.66 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0557  cardiolipin synthetase  32.31 
 
 		 514 aa  163  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4044  phospholipase D/transphosphatidylase  33.69 
 
 		 385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.185859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.68 
 
 		 485 aa  163  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.77 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>