More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0907 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  85.96 
 
 		 413 aa  749    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  86.44 
 
 		 413 aa  751    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  99.76 
 
 		 413 aa  852    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  100 
 
 		 413 aa  855    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  86.2 
 
 		 413 aa  748    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  86.2 
 
 		 413 aa  749    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  86.44 
 
 		 413 aa  751    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  83.05 
 
 		 413 aa  731    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  85.96 
 
 		 413 aa  749    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  85.96 
 
 		 413 aa  749    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  99.76 
 
 		 413 aa  852    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  99.76 
 
 		 413 aa  852    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  86.2 
 
 		 413 aa  751    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  85.71 
 
 		 413 aa  745    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  99.76 
 
 		 413 aa  852    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  64.09 
 
 		 401 aa  519  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  64.54 
 
 		 401 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  55.77 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  51.14 
 
 		 460 aa  435  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  52.8 
 
 		 422 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  55.7 
 
 		 405 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  52.24 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  53.77 
 
 		 428 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  54.07 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  51.21 
 
 		 400 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  56.57 
 
 		 416 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  54.72 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  51.87 
 
 		 400 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  51.99 
 
 		 400 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  56.51 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  50.63 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  51.89 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  52.81 
 
 		 401 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  51.61 
 
 		 401 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  54.83 
 
 		 363 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  50.13 
 
 		 416 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  49.52 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  48.96 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  40.32 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  37.5 
 
 		 383 aa  242  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  37.09 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  39.17 
 
 		 461 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  35.84 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  36.79 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.71 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.97 
 
 		 422 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.82 
 
 		 384 aa  219  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  35.86 
 
 		 442 aa  216  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  36.62 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  38.4 
 
 		 424 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  38.12 
 
 		 424 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  38.12 
 
 		 424 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.48 
 
 		 419 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  32.92 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  39.35 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  35.77 
 
 		 424 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  38.16 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  35.01 
 
 		 424 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  35.7 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  38.62 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  39.48 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  39.48 
 
 		 410 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  34.92 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  38.62 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  39.48 
 
 		 424 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  39.48 
 
 		 424 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  39.48 
 
 		 424 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  34.24 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  35.35 
 
 		 409 aa  200  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.35 
 
 		 409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  35.26 
 
 		 414 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  35.41 
 
 		 439 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  37.95 
 
 		 437 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  31.38 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  32.51 
 
 		 422 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.66 
 
 		 478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  34.41 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  33.83 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.12 
 
 		 420 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  34.36 
 
 		 385 aa  173  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  34.34 
 
 		 385 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  35.12 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0271  putative synthetase  31.28 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  34.97 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  31.2 
 
 		 486 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.02 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  30.96 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  33.24 
 
 		 487 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  34.15 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.34 
 
 		 395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.93 
 
 		 474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  31.78 
 
 		 406 aa  163  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  30.68 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.63 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  33.53 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  30.75 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.34 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.72 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  30.75 
 
 		 478 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0862  phospholipase D/transphosphatidylase  35.31 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>