More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0047 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  100 
 
 		 416 aa  843    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  70.38 
 
 		 433 aa  574  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  71.11 
 
 		 436 aa  558  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  69.44 
 
 		 416 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  67.26 
 
 		 422 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  64.34 
 
 		 403 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  64.34 
 
 		 405 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  61.59 
 
 		 460 aa  511  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  62.32 
 
 		 413 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  56.76 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  56.76 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  56.76 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  56.76 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  59.1 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  56.51 
 
 		 413 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  58.1 
 
 		 400 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  56.85 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  56.61 
 
 		 400 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  56.42 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  56.42 
 
 		 413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  56.42 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  56.61 
 
 		 400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  56.86 
 
 		 400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  56.42 
 
 		 413 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  56.68 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  56.17 
 
 		 413 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  56.42 
 
 		 413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  56.42 
 
 		 413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  56.17 
 
 		 413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  56.61 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  56.03 
 
 		 401 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  56.2 
 
 		 401 aa  435  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  55.93 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  57.49 
 
 		 363 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  56.86 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  55.53 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  51.01 
 
 		 416 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  51.28 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  42.77 
 
 		 396 aa  240  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  38.48 
 
 		 383 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  42.23 
 
 		 461 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  37.15 
 
 		 451 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  39.56 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.55 
 
 		 384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  37.24 
 
 		 411 aa  210  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  37.91 
 
 		 422 aa  205  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  38.98 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.44 
 
 		 422 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  40.41 
 
 		 424 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  40.41 
 
 		 424 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  40.41 
 
 		 424 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  40.92 
 
 		 424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  40.92 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  40.61 
 
 		 437 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  39.09 
 
 		 426 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  38.9 
 
 		 409 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.42 
 
 		 422 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  40.12 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.36 
 
 		 409 aa  193  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  38.69 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  40.12 
 
 		 424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  42.24 
 
 		 424 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  37.31 
 
 		 439 aa  189  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  42.24 
 
 		 410 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  42.24 
 
 		 424 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  42.24 
 
 		 424 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  42.24 
 
 		 424 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  42.24 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  42.24 
 
 		 424 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  39.89 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  36.46 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  39.61 
 
 		 419 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.66 
 
 		 419 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  37.06 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  34.6 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  36.71 
 
 		 422 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  36 
 
 		 385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  38.46 
 
 		 386 aa  174  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  32.98 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  34.39 
 
 		 483 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  34.71 
 
 		 458 aa  170  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.31 
 
 		 445 aa  169  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  35.5 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  33.42 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  34.63 
 
 		 490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  36.07 
 
 		 481 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  32.65 
 
 		 479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  33.72 
 
 		 479 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  32.5 
 
 		 479 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  31.49 
 
 		 487 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  32.22 
 
 		 481 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  32.54 
 
 		 479 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  33.62 
 
 		 478 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  32.75 
 
 		 479 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.55 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  34.25 
 
 		 491 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  33.63 
 
 		 484 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  34.82 
 
 		 480 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  33.7 
 
 		 479 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.95 
 
 		 392 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>