More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0658 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  95.47 
 
 		 419 aa  784    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 419 aa  843    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  69.48 
 
 		 426 aa  609  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  65.96 
 
 		 424 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  65.96 
 
 		 424 aa  531  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  65.26 
 
 		 424 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  65.26 
 
 		 424 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  65.26 
 
 		 424 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  65.24 
 
 		 424 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  65.48 
 
 		 424 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  66.59 
 
 		 424 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  66.82 
 
 		 424 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  66.82 
 
 		 424 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  66.82 
 
 		 424 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  66.82 
 
 		 424 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  66.82 
 
 		 424 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  66.59 
 
 		 424 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  68.4 
 
 		 410 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  43.86 
 
 		 410 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  41.48 
 
 		 411 aa  256  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  39.61 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  44.17 
 
 		 414 aa  252  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  40.75 
 
 		 383 aa  249  9e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  42.82 
 
 		 461 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  43.04 
 
 		 409 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.29 
 
 		 409 aa  246  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  43.6 
 
 		 442 aa  243  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  43.69 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  41.2 
 
 		 422 aa  239  9e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.53 
 
 		 422 aa  236  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.53 
 
 		 422 aa  236  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  42.29 
 
 		 422 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  39.95 
 
 		 413 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  39.95 
 
 		 413 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  39.95 
 
 		 413 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  39.95 
 
 		 413 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  39.95 
 
 		 413 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  40.48 
 
 		 413 aa  227  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  37.19 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.21 
 
 		 384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  40.91 
 
 		 405 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  41.03 
 
 		 403 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  40.21 
 
 		 413 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  40.21 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  40.21 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  40.21 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  40.21 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  40.48 
 
 		 413 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  39.95 
 
 		 413 aa  209  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  40.21 
 
 		 413 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  40.21 
 
 		 413 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  34.99 
 
 		 451 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  39.3 
 
 		 400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  40.99 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  38.22 
 
 		 413 aa  196  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  42.45 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  39.88 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  40.34 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  39.3 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  37.5 
 
 		 460 aa  192  8e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  37.61 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  38.76 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  39.47 
 
 		 400 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  38.71 
 
 		 400 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  40.11 
 
 		 416 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  38.95 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  40.28 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  38.04 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  36.88 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  34.49 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  36.26 
 
 		 416 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  33.16 
 
 		 482 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  40.35 
 
 		 416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  40.46 
 
 		 437 aa  163  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  31.45 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.07 
 
 		 485 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21690  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  30.67 
 
 		 422 aa  160  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  34.53 
 
 		 382 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  32.65 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  31.91 
 
 		 502 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.42 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  32.17 
 
 		 386 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  40 
 
 		 363 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  32.05 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  32.49 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  30.34 
 
 		 458 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.39 
 
 		 420 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.2 
 
 		 478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.05 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  30.53 
 
 		 486 aa  156  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  35.73 
 
 		 416 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  31.91 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.32 
 
 		 445 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  30.03 
 
 		 486 aa  153  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  31.71 
 
 		 462 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  33.69 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.51 
 
 		 478 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.63 
 
 		 474 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  33.6 
 
 		 478 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.99 
 
 		 487 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>