More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4017 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 451 aa  902    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  59.72 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  44.82 
 
 		 461 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  41.26 
 
 		 383 aa  275  8e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  44.14 
 
 		 411 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  40.79 
 
 		 396 aa  262  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  42.21 
 
 		 442 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  42.82 
 
 		 439 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  45.43 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.84 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  39.95 
 
 		 422 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  40.29 
 
 		 397 aa  242  9e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  42.23 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.73 
 
 		 422 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.12 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  40.75 
 
 		 409 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  39.83 
 
 		 401 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  38.18 
 
 		 416 aa  233  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.21 
 
 		 409 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  40.89 
 
 		 414 aa  229  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  39.83 
 
 		 401 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  38.9 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  38.24 
 
 		 400 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  37.35 
 
 		 424 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  36.41 
 
 		 400 aa  226  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  38.46 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  37.44 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  36.79 
 
 		 424 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  41.19 
 
 		 422 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  37.97 
 
 		 400 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  37.69 
 
 		 413 aa  223  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  38.1 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  36.58 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  37.35 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  37.47 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  36.79 
 
 		 424 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  36.27 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  35.8 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  35.8 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  35.8 
 
 		 424 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  37.66 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  37.9 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  35.88 
 
 		 433 aa  212  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  35.75 
 
 		 416 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  32.91 
 
 		 413 aa  211  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  33.17 
 
 		 413 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  33.17 
 
 		 413 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  33.17 
 
 		 413 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  33.17 
 
 		 413 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  33.17 
 
 		 413 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  33.92 
 
 		 413 aa  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  33.92 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  33.92 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  33.92 
 
 		 413 aa  207  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  33.92 
 
 		 413 aa  207  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  33.84 
 
 		 413 aa  207  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  33.92 
 
 		 413 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  33.92 
 
 		 413 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  33.67 
 
 		 413 aa  206  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  37.66 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  36.01 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  36.29 
 
 		 416 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  35.89 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  40.57 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.73 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  37.68 
 
 		 410 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  37.68 
 
 		 424 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  37.44 
 
 		 424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  37.44 
 
 		 424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  37.44 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  37.44 
 
 		 424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  37.44 
 
 		 424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  37.7 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  37.83 
 
 		 417 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  36.99 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.4 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.86 
 
 		 486 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.89 
 
 		 474 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  33.85 
 
 		 385 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  35.81 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  31.82 
 
 		 396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0862  phospholipase D/transphosphatidylase  35.34 
 
 		 370 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.46 
 
 		 474 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  33.51 
 
 		 486 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  35.37 
 
 		 385 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.74 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  33.42 
 
 		 477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  32.66 
 
 		 486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  34.34 
 
 		 385 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  37.67 
 
 		 359 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.06 
 
 		 481 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  28.83 
 
 		 509 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  34.35 
 
 		 385 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  31.48 
 
 		 483 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.86 
 
 		 385 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  32.63 
 
 		 486 aa  170  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  34.87 
 
 		 382 aa  170  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  32.18 
 
 		 480 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  31.86 
 
 		 487 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  31.25 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>