More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0892 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  100 
 
 		 385 aa  780    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  96.88 
 
 		 385 aa  754    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  92.47 
 
 		 385 aa  731    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  98.7 
 
 		 385 aa  769    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  78.12 
 
 		 385 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4044  phospholipase D/transphosphatidylase  74.03 
 
 		 385 aa  584  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.185859  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4349  phospholipase D family protein  72.73 
 
 		 385 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  67.89 
 
 		 382 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  66.41 
 
 		 385 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  62.57 
 
 		 386 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  66.48 
 
 		 359 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0862  phospholipase D/transphosphatidylase  48.26 
 
 		 370 aa  315  7e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0271  putative synthetase  46.23 
 
 		 392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.86 
 
 		 392 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  31.91 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  31.65 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.32 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.17 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  32.42 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4046  phospholipase D/transphosphatidylase  35.58 
 
 		 406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.01 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  34.82 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  31.52 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  30.52 
 
 		 514 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  30.33 
 
 		 514 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  30.52 
 
 		 514 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  30.25 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  30.25 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  30.25 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  30.25 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  30.25 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  30.25 
 
 		 514 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  32.25 
 
 		 478 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  29.89 
 
 		 514 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  29.95 
 
 		 502 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  29.7 
 
 		 514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  31.15 
 
 		 462 aa  173  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.54 
 
 		 490 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  31.58 
 
 		 483 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  32.87 
 
 		 479 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  31.82 
 
 		 479 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  31.82 
 
 		 479 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  31.82 
 
 		 479 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  31.82 
 
 		 479 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  31.82 
 
 		 479 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  31.82 
 
 		 479 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  31.82 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  31.34 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.31 
 
 		 485 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 		 484 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  31.02 
 
 		 479 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  32.86 
 
 		 481 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  26.94 
 
 		 476 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  30.87 
 
 		 479 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  33.84 
 
 		 451 aa  169  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  32.51 
 
 		 419 aa  169  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  33.05 
 
 		 479 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  29.41 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  32.57 
 
 		 479 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2014  cardiolipin synthetase  31.66 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0180  putative cardiolipin synthetase  31.66 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  30.48 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  35.98 
 
 		 416 aa  167  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  32.02 
 
 		 479 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  32.35 
 
 		 490 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  26.67 
 
 		 476 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4507  phospholipase D/transphosphatidylase  33.24 
 
 		 372 aa  166  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0906  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.58 
 
 		 427 aa  166  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.811495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  31.93 
 
 		 483 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  30.73 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  30.61 
 
 		 479 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  34.64 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  35.56 
 
 		 486 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  35.06 
 
 		 405 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  32.28 
 
 		 480 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  31.02 
 
 		 479 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  31.02 
 
 		 479 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  31.35 
 
 		 458 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2012  cardiolipin synthetase  31.55 
 
 		 479 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.84 
 
 		 486 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  30.87 
 
 		 479 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  30.68 
 
 		 413 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  30.68 
 
 		 413 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  30.68 
 
 		 413 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  30.68 
 
 		 413 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  30.68 
 
 		 413 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  35.06 
 
 		 403 aa  162  9e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  29.49 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  34.27 
 
 		 424 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  33.71 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  30.58 
 
 		 479 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0455  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.76 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778315 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  33.15 
 
 		 481 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  34.53 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0278  phospholipase D family protein  33.24 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  34.26 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  31.18 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.65 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  31.08 
 
 		 477 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  31.08 
 
 		 477 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>