More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1216 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
420 aa  870    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  79.05 
 
 
420 aa  689    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  80.71 
 
 
420 aa  699    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  59.9 
 
 
425 aa  513  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  59.47 
 
 
419 aa  496  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2290  phospholipase D/transphosphatidylase  59.76 
 
 
427 aa  487  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  hitchhiker  0.000316655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  43.99 
 
 
446 aa  348  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0906  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.57 
 
 
427 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.811495  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  39.95 
 
 
436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  36.22 
 
 
502 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.4 
 
 
485 aa  236  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  36.51 
 
 
477 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  34.72 
 
 
514 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  35.95 
 
 
502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  34.44 
 
 
514 aa  233  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  34.17 
 
 
514 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  34.17 
 
 
514 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  34.17 
 
 
514 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  34.17 
 
 
514 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  34.17 
 
 
514 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  34.17 
 
 
514 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  34.44 
 
 
514 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  34.44 
 
 
514 aa  229  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  33.88 
 
 
483 aa  228  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.34 
 
 
541 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  33.98 
 
 
514 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  34.23 
 
 
480 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.51 
 
 
472 aa  224  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.46 
 
 
478 aa  222  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  31.93 
 
 
509 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  35.71 
 
 
480 aa  222  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  31.93 
 
 
509 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  35.32 
 
 
474 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3721  phospholipase D/transphosphatidylase  36.63 
 
 
439 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  31.66 
 
 
509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  31.66 
 
 
509 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  31.4 
 
 
509 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  31.66 
 
 
509 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  31.13 
 
 
509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.24 
 
 
482 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  36.46 
 
 
474 aa  219  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  31.13 
 
 
509 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  31.13 
 
 
509 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.09 
 
 
474 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  31.13 
 
 
509 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.54 
 
 
374 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  33.9 
 
 
484 aa  217  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  36.63 
 
 
490 aa  217  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.94 
 
 
478 aa  216  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  33.42 
 
 
485 aa  216  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  35.95 
 
 
481 aa  216  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  34.52 
 
 
462 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05796  phospholipase D active site domain protein  51.43 
 
 
404 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  34.82 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.58 
 
 
490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.54 
 
 
481 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  33.6 
 
 
488 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  33.07 
 
 
479 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  34.93 
 
 
486 aa  213  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.11 
 
 
478 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.53 
 
 
474 aa  213  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  35.11 
 
 
478 aa  213  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  34.12 
 
 
478 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  35.09 
 
 
476 aa  212  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.09 
 
 
476 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 
483 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  31.86 
 
 
396 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  33.1 
 
 
476 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  34.86 
 
 
494 aa  210  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.32 
 
 
489 aa  210  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  34.86 
 
 
494 aa  210  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  32.55 
 
 
479 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3346  phospholipase D/Transphosphatidylase  35 
 
 
395 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  33.51 
 
 
385 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  32.38 
 
 
481 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  32.38 
 
 
479 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  32.64 
 
 
479 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4046  phospholipase D/transphosphatidylase  36.26 
 
 
406 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.89 
 
 
478 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  35.04 
 
 
486 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  32.7 
 
 
458 aa  207  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  35.11 
 
 
385 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.61 
 
 
445 aa  206  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  34.05 
 
 
502 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  35.33 
 
 
479 aa  206  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  30.73 
 
 
505 aa  206  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  30.73 
 
 
505 aa  206  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.15 
 
 
492 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.15 
 
 
477 aa  205  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  32.08 
 
 
441 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  34.77 
 
 
486 aa  204  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.92 
 
 
476 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  34.06 
 
 
382 aa  203  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  33.16 
 
 
478 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  32.55 
 
 
477 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  32.9 
 
 
483 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  32.55 
 
 
477 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  32.64 
 
 
479 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  34.5 
 
 
486 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  33.96 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>